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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002212`

染色体: Chr01 坐标: 38440856-38445602 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002212`
名称	SmilChr01G002212
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38440856 - 38445602 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014356`
GeneID	`131014356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014356`
原始查询	`LOC131014356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1-like
产物	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1-like
Arabidopsis	`AT4G08500` (MEKK1) MAPK/ERK kinase kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826409] identity=45.6; qcov=0.995; evalue=5.26e-144; confidence=high
Rice	`Os03g0262200` - identity=54.9; qcov=0.664; evalue=6.54e-133; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798292.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057798292.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798292.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057798292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38441358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:38442067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B21,B95
`Chr1:38443719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:38443749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:38445193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C8
`Chr1:38445194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798292.1

595 aa

298

595

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 329-580 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 332-575 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798292.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	329	580	2.9e-67	227.5	Protein kinase domain
`XP_057798292.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	332	575	1.3e-49	169.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942309.1
AAGTAACAAAAATGAGGCCAATTAGAAAATTCAGATGTCAATACACAATCAGTTCAATGCACCGCGTCTGCTCCACAGGTTCATAATTCTCTCTCTCTCTCTGGCGCCGTTTTGCTGGTCTCTCTTTGCCTCTTTCCTCTTAACTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACAGTGACAGAGTTTCTGCTCTAAGCCCCAAAATCAGCTTAATTTTACGAACTCCGCGCAATTATTGAAGATTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014356
ATGAAAATGCATCGATTTCCGAAGCTCTTCTCCCATAGGTCGGAGCCGCGCAAGAGCGGCGCAGATTCCAGCTCCAGCCGCCGGCCGGCGAAGCCGAAGAGGCTCGAACGGAGCAACGCACTCAGGAATGTCAACTACGAGTTCTCTCTGTCTAGTTCAGCTTCGTTTTCGTCGCACTCGCCGGAGGAGTCGCAGCGTGCGAGCTCCTTGGATTTGTACAGCGGGAAGACGACGAGCTTCCGTGTGGATGGGACCGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798292.1
MKMHRFPKLFSHRSEPRKSGADSSSSRRPAKPKRLERSNALRNVNYEFSLSSSASFSSHSPEESQRASSLDLYSGKTTSFRVDGTEGEFQVICEAFGFSGIDDFAISPEEYEAMKVGSSTPGMVSKTLEPLYQETEVDCDDVVKFSYGNGYIGAIDVIDRKIEGLSVGNLDNSYGLASKKLGETCDFGYSNRARGVSELSTRLEDGVSFNDKLSVRSKASRMTGIKGARPTIVVPDWDTSTRFLQERDPRIPKFQSRFFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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