当前解析结果
SmilChr03G003469| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003469 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003469 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003469 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 53156395 - 53162901 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014357 |
|---|---|
| GeneID | 131014357 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014357 |
| 原始查询 | LOC131014357 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832729]; symbol=AT5G26610; hit=AT5G26610; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832729]; symbol=AT5G26610; hit=AT5G26610; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G26610 (AT5G26610)D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832729] identity=66.9; qcov=1.02; evalue=6.65e-129; confidence=high |
| Rice | Os04g0115400- identity=76.2; qcov=0.35; evalue=1.53e-54; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01585 (G-patch) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014357 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798293.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057798293.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798293.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798293.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798293.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:53161030 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:53161870 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798293.1PF01585
G-patch 64-104 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798293.1 |
Pfam | PF01585 |
G-patch | Family | 64 | 104 | 4.7e-16 | 59.1 | G-patch domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。