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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003473`

染色体: Chr03 坐标: 53211842-53215937 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003473`
名称	SmilChr03G003473
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53211842 - 53215937 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014361`
GeneID	`131014361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014361`
原始查询	`LOC131014361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
产物	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
Arabidopsis	`AT2G30933` (AT2G30933) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3767975] identity=62.4; qcov=0.325; evalue=4.86e-39; confidence=low
Rice	`Os03g0833600` - identity=50; qcov=0.594; evalue=1.38e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798297.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057798297.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057798297.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798297.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53212086`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A5,B64,C24,C73
`Chr3:53212086`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A5,B64,C24,C73
`Chr3:53212351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,A9,B82
`Chr3:53212415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B136,B26,C43,C52
`Chr3:53212749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B109,B112,B22,D11
`Chr3:53212782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr3:53212837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:53212881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798297.1

287 aa

144

287

PF07983 X8 111-181 aa

XP_057798298.1

286 aa

143

286

PF07983 X8 111-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798297.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	111	181	5.9e-21	75.6	X8 domain
`XP_057798298.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	111	181	5.8e-21	75.6	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942315.1
AAAGCAACCACTTTTCTTGGTGATCAACTCGACATATTCCTTCTTCTTTAACTTTATACCTTCCATCGGCCGTAACCCTTTATCTTCTTCTGCCTTTTCTGCTCAGCCCGACTTTTCCATCAAATCTTATAAGTTAGTTTAGAAACACTGCGACGCCATTATTAACTTATATTCATCTCGATCCATCTTCTGCGCCATTAAAATGGATACAGCAGCTTCCAATAAGTTCCTTTTCATATTTCTCCTTTCTTACATTTTCA...

XM_057942314.1
GTGATCAACTCGACATATTCCTTCTTCTTTAACTTTATACCTTCCATCGGCCGTAACCCTTTATCTTCTTCTGCCTTTTCTGCTCAGCCCGACTTTTCCATCAAATCTTATAAGTTAGTTTAGAAACACTGCGACGCCATTATTAACTTATATTCATCTCGATCCATCTTCTGCGCCATTAAAATGGATACAGCAGCTTCCAATAAGTTCCTTTTCATATTTCTCCTTTCTTACATTTTCATGGTCTGCTCATCAGGCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014361
ATGGATACAGCAGCTTCCAATAAGTTCCTTTTCATATTTCTCCTTTCTTACATTTTCATGGTCTGCTCATCAGGCTCATTCCTTTCGGTATATAAGGGGCGCAGAGAGTTGATCCAAACAACTCAACACGATACCATCAATCCTCCTTTCACAACCTCTCCGGTAACCAATCCGGTCACCACCCCAGCCACCTACCCACCGGACGCTTCCGCGCCGCCACTAGTCACCGTTCCTTCGGCCAACCCGGTCCTTCCGCCGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798297.1
MDTAASNKFLFIFLLSYIFMVCSSGSFLSVYKGRRELIQTTQHDTINPPFTTSPVTNPVTTPATYPPDASAPPLVTVPSANPVLPPAIFPVSPAFPNPPIQAGGGAAAGQSWCVARSGVPETVLQVALDYACGMGGADCSGIQQGAACYNPTTLQNHASYAFNAYYQKNPLPTSCDFGGAAVLTNANPSSGSCVFPTSSSASPATVSPTTTTTTPAMPAPATDFSSGAGSTGTPPTVLNASNPALGGDIGGFAETPPTAG...

XP_057798298.1
MDTAASNKFLFIFLLSYIFMVCSSGSFLSVYKGRRELIQTTQHDTINPPFTTSPVTNPVTTPATYPPDASAPPLVTVPSANPVLPPAIFPVSPAFPNPPIQAGGGAAAGQSWCVARSGVPETVLQVALDYACGMGGADCSGIQQGAACYNPTTLQNHASYAFNAYYQKNPLPTSCDFGGAAVLTNANPSSGSCVFPTSSSASPATVSPTTTTTTPAMPAPATDFSSGAGTGTPPTVLNASNPALGGDIGGFAETPPTAGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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