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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003479`

染色体: Chr03 坐标: 53338559-53342133 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003479`
名称	SmilChr03G003479
描述	hydroxycinnamoyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53338559 - 53342133 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014367`
GeneID	`131014367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014367`
原始查询	`LOC131014367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxycinnamoyltransferase-like
产物	hydroxycinnamoyltransferase-like
Arabidopsis	`AT4G29250` (AT4G29250) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829046] identity=30; qcov=1.01; evalue=8.59e-61; confidence=low
Rice	`Os04g0611200` (OsCER2) - identity=28.3; qcov=0.948; evalue=3.19e-30; confidence=low
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798308.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798308.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798308.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798308.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53338846`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B80
`Chr3:53338846`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B80
`Chr3:53338850`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B80
`Chr3:53338850`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B80
`Chr3:53339113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:53339287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:53339436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C68
`Chr3:53339529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:53341503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:53341577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:53341788`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A14,A18,A25,A3,A5,B102,B106,B111,B114,B127,B129,B26,B27,B34,B46,B50,B55,B59,B6,B87,B90,B92,C13,C15,C20,C23,C24,C28,C33,C34,C43,C55,C6,C70,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798308.1

459 aa

230

459

Transferase

PF02458 Transferase 52-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798308.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	52	443	1.2e-47	163.3	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942325.1
TCCAAAGTAGCCAGAAGAAATAATTTAGTATTCGTATATTACTATGTTATTGAGCCCCTGGATATTTTGATTGTCCACTAGTGCTCAAATTTAAATTTTGGTGCAGCAACAGTGAGGCGTAAATGCTGCCCGCCGCATTTATTATAACGATCACCACCACCACCAATATAATCAATAATCCCATTTATAATACCAACTAACACCCCTCCACCCACCCAACCACCCTCACCCCCCCATCCCTCACGCCTCTCTATACTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014367
ATGCTTTATATGTTGTGCTTCTCTGCAACTCAACTGATCACTTGGAATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGAGCAGGGAAGGCGCAGTAGAGTGAAACTGGAGTCGATATTGAGTGTGGTATCCGGCAAGCCAACCGAGCCCGGGAAAATACACAAGCTGTCGTTGTTGGATCGGGCCATGCGCCCGCATACGATCCACATTGTGTTCTACTACGGGTCGAACCCCTTCCTGGATGGCCCGATGCCGTCGGACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798308.1
MLYMLCFSATQLITWNIEREREREMEQGRRSRVKLESILSVVSGKPTEPGKIHKLSLLDRAMRPHTIHIVFYYGSNPFLDGPMPSDLGNLRVTLSELLDEYPYVTGRLTQEPDGDWQIKFNDAGVRMLQATVDATIDEWLRSADAAEERDLTAWEEMPHDPTFWSPFRLQINKFKCGGLALGLSCTHMHTDLTSATMLFKAWSEVHRRQPPTHPPIFELPPPLTPTPPIPTPSPHPTAPTKLATATFKFSAAAVDKCLSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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