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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003510`

染色体: Chr03 坐标: 53712674-53716261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003510`
名称	SmilChr03G003510
描述	chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53712674 - 53716261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014402`
GeneID	`131014402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014402`
原始查询	`LOC131014402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic
产物	chlorophyll(ide) b reductase NOL%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G04900` (NOL) NYC1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830372] identity=78.2; qcov=0.816; evalue=6.6e-169; confidence=high
Rice	`Os03g0654600` (NOL) - identity=82.2; qcov=0.732; evalue=3.88e-164; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF02719 (Polysacc_synt_2); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2); PF23441 (SDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798341.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057798341.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057798341.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057798341.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798341.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53716016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798341.1

354 aa

177

354

SDR

Polysacc_synt_2

adh_short

adh_short_C2

PF23441 SDR 76-273 aa PF08659 KR 77-185 aa PF02719 Polysacc_synt_2 77-200 aa PF00106 adh_short 77-272 aa PF13561 adh_short_C2 83-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798341.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	76	273	1.4e-07	31.9	SDR-like rossmann domain
`XP_057798341.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	77	185	2.5e-07	31.5	KR domain
`XP_057798341.1`	Pfam	`PF02719`	Polysacc_synt_2	Family	77	200	0.00017	21.6	Polysaccharide biosynthesis protein
`XP_057798341.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	77	272	2.2e-42	145.5	short chain dehydrogenase
`XP_057798341.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	83	277	7.5e-32	111.5	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942358.1
TATAAATTACTGTAGTATTTACTGCATTCTTCTTCTTCTTCGTCCCTTTAGCGTTATCTACTGCTAGTATCTTCTTCGCCGTTGCTGCTTCACTTTTCATTTTTTCTTCTACTTTTCTTTAATCTGACTCAGCGATGATTGCAGCAGCAGCTATGGCAATTTCAACTTCTTATCCCCCAAATCTTTCATTTAACACTCGCTTACCACTTCAAAAGCTGAACCGCCATTGTTATTTTACGCTTTATTTCACCAACAAAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014402
ATGATTGCAGCAGCAGCTATGGCAATTTCAACTTCTTATCCCCCAAATCTTTCATTTAACACTCGCTTACCACTTCAAAAGCTGAACCGCCATTGTTATTTTACGCTTTATTTCACCAACAAAACTAATCCCTCCAATTATAACTCCCTTTCTGTACGAAACGCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGTTGAGAAGAATAATAGTGAGCCGATGATTCCACCATATAATGTTTTGATCACTGGTTCCACTAAAGGAATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798341.1
MIAAAAMAISTSYPPNLSFNTRLPLQKLNRHCYFTLYFTNKTNPSNYNSLSVRNASSSSSSAVEKNNSEPMIPPYNVLITGSTKGIGYALAKEFLKSGDNVIICSRSEERVKSAIESLKVESGKQHVWGTKCDVRDGNDVKNLVAFSKEKLKYIDIWINNAGSNAYSYKPLMEASDQDLIEVVSTNTLGLMICCREAMNMMQKQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVQNVLVHNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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