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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003513`

染色体: Chr03 坐标: 53734229-53738408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003513`
名称	SmilChr03G003513
描述	uncharacterized SmilChr03G003513
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53734229 - 53738408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014403`
GeneID	`131014403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014403`
原始查询	`LOC131014403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GATA zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831962]; symbol=NUFIP; hit=AT5G18440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	GATA zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831962]; symbol=NUFIP; hit=AT5G18440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G18440` (NUFIP) GATA zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831962] identity=41.5; qcov=0.577; evalue=1.31e-57; confidence=medium
Rice	`Os01g0814000` - identity=40.1; qcov=0.448; evalue=3.01e-41; confidence=low
GO	GO:0000492 (box C/D snoRNP assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10453 (NUFIP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798342.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057798342.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798342.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798342.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53734583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:53734633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C33,C61
`Chr3:53734792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B118,C68,C9
`Chr3:53735591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B9,C2,C36
`Chr3:53736172`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr3:53736172`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B59
`Chr3:53736905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B133,B59,B99
`Chr3:53737733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:53737836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798342.1

518 aa

259

518

NUFIP1

PF10453 NUFIP1 274-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798342.1`	Pfam	`PF10453`	NUFIP1	Family	274	311	1.3e-11	44.9	FMR1-interacting protein 1 (NUFIP1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942359.1
AGTCCGAAATAAGAAAAACTCGAAGGATTAGAAAACTAACCTTTTGAAAGATAAAACTCCGAAAATCAGAAATCTCTAAAACCCTACTGGAGCCAATAAACTCAACAGAAGCAAAAAAAGAAACTGCAAACGGACATGCTTCCTCACTTCAATTCTCACCTCCACAACCCTAACAATCAACTTCAACTCAATGGAGCTAATGCTTCAGCTCCACATCAGGTTATGGGGAGCCAAGGCAATTTAGGGCAAATAAACCCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014403
ATGCTTCCTCACTTCAATTCTCACCTCCACAACCCTAACAATCAACTTCAACTCAATGGAGCTAATGCTTCAGCTCCACATCAGGTTATGGGGAGCCAAGGCAATTTAGGGCAAATAAACCCTCAGTTTCGACCGGGAGTGCTCAATAATGCTCAGCTGCCAATGCCACCCTTTACGAACCCAAATCCCTTTTTTGCTCCAAACCAATTTTTCCCCTTTCCACAAGGCGCTTTCCACAACCTAAATGCTAACAATTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798342.1
MLPHFNSHLHNPNNQLQLNGANASAPHQVMGSQGNLGQINPQFRPGVLNNAQLPMPPFTNPNPFFAPNQFFPFPQGAFHNLNANNLPQPFAQNAINPAQFLPNWQLNMPNLVQNVTQLLQMQMMNAAPQDLGLFMNAQSGAGSNNGVLPLPVDGNSLTRMNHNNAVTKDIGVHHAQRNWDIFSPGAANPQSDAGVVNDVNDRKNTWRKPHDKNFTGNHKHNESQRGFGNKQFHTRQNAQGNFKFNNENRGKGNKKFVGKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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