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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003548`

染色体: Chr03 坐标: 54109697-54111990 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003548`
名称	SmilChr03G003548
描述	40S ribosomal protein S13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54109697 - 54111990 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014430`
GeneID	`131014430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014430`
原始查询	`LOC131014430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S13-like
产物	40S ribosomal protein S13-like
Arabidopsis	`AT4G00100` (RPS13A) ribosomal protein S13A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828167] identity=94; qcov=1; evalue=3.75e-102; confidence=high
Rice	`Os08g0117300` - identity=88.1; qcov=1; evalue=3.89e-94; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005730 (nucleolus); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00312 (Ribosomal_S15); PF08069 (Ribosomal_S13_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798394.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798394.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798394.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798394.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54110017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:54110194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B119,B123,B125,B130,B135,B139,B53,B75,B87,C16,C28,C29,C52,C54,D11,D4
`Chr3:54110205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:54110259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr3:54110267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B78,C73,C78
`Chr3:54110272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B78,C73,C78
`Chr3:54110279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C73
`Chr3:54110684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr3:54111741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798394.1

151 aa

151

Ribosomal_S13_N

Ribosomal_S15

PF08069 Ribosomal_S13_N 1-60 aa PF00312 Ribosomal_S15 74-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798394.1`	Pfam	`PF08069`	Ribosomal_S13_N	Domain	1	60	3.4e-32	111.0	Ribosomal S13/S15 N-terminal domain
`XP_057798394.1`	Pfam	`PF00312`	Ribosomal_S15	Domain	74	146	2.6e-15	57.1	Ribosomal protein S15

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942411.1
CAGTTTAAACCCACAAATATTACAAAACCCTAGTCGTCAACCTTTTCATCGAGCTAGTGTTGGTGGCCGTTGATTTTAGGGAACAGCCGACCCTCAGAAGCAAACAGAGTGCTGCGCCGCCACCGCTGCCGTCGCCATGGGTCGCATGCACAGCCGCGGAAAGGGTATTTCCGCTTCAGCCCTTCCATACAAGAGAACCCCGCCCAGCTGGCTCAAAATCTCCTCTGAAGATGTTGAGGAGAATATCTGTAAGTTTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014430
ATGGGTCGCATGCACAGCCGCGGAAAGGGTATTTCCGCTTCAGCCCTTCCATACAAGAGAACCCCGCCCAGCTGGCTCAAAATCTCCTCTGAAGATGTTGAGGAGAATATCTGTAAGTTTGCAAAGAAGGGTCTCACTCCGTCGCAGATCGGCGTGATTCTCCGTGATTCACACGGCATTGCACAGGTGAAGAGCGTCACCGGAAGCAAGATTCTCCGCATTCTCAAGGGTCACGGACTTGCACCTGAAATTCCAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798394.1
MGRMHSRGKGISASALPYKRTPPSWLKISSEDVEENICKFAKKGLTPSQIGVILRDSHGIAQVKSVTGSKILRILKGHGLAPEIPEDLYHLIKKAVAIRKHLERNRKDKDSKFRLILVESRIHRLARYYKKTKKLPPVWKYESTTASTLVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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