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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000419`

染色体: Chr01 坐标: 8457049-8457720 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000419`
名称	SmilChr01G000419
描述	uncharacterized SmilChr01G000419
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8457049 - 8457720 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014434`
GeneID	`131014434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014434`
原始查询	`LOC131014434`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF2996 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814937]; symbol=AT2G04039; hit=AT2G04039; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF2996 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814937]; symbol=AT2G04039; hit=AT2G04039; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G04039` (AT2G04039) DUF2996 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814937] identity=75; qcov=0.812; evalue=6.35e-56; confidence=high
Rice	`Os07g0607800` (OSJNBa0072I06.32) - identity=65.7; qcov=0.789; evalue=3.73e-51; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11210 (DUF2996)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798431.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798431.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798431.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798431.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8457059`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B115,C10,C73
`Chr1:8457059`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B115,C10,C73
`Chr1:8457175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A14,A8,B46
`Chr1:8457175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A8,B46
`Chr1:8457192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,C10,C33,C41,C73
`Chr1:8457199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B119,B31,C24
`Chr1:8457349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:8457429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B76,B81,C15
`Chr1:8457570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A18,B110,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr1:8457579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B108,B115,B118,B128,B136,B31,B7,B73,B98,C43,C49,C5,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798431.1

133 aa

133

DUF2996

PF11210 DUF2996 19-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798431.1`	Pfam	`PF11210`	DUF2996	Family	19	124	3.5e-15	57.3	Protein of unknown function (DUF2996)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942448.1
TGGAAGCCGGAAGGCGCAACTGCAGACACTTCTAAACCAAAGCCAAAGCCAAAGGTTGCAGCAAAAGCTCTGCCTGAAATGATGGAAGAGGATGTCATCCCTTCACTCAAGGCAACTCTAGAAGCTCAGCAAGATATCTCCGAGCTCGAGCTTTCCTTCAATGAGAACAAGTTGGAAGGCTCTTTCGTGAAGAAGGAGATACCTTATTCATTCTGGGCATTTTTCCCAGATGGGACTCTCAATGGACCCAAGGGTTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014434
TGGAAGCCGGAAGGCGCAACTGCAGACACTTCTAAACCAAAGCCAAAGCCAAAGGTTGCAGCAAAAGCTCTGCCTGAAATGATGGAAGAGGATGTCATCCCTTCACTCAAGGCAACTCTAGAAGCTCAGCAAGATATCTCCGAGCTCGAGCTTTCCTTCAATGAGAACAAGTTGGAAGGCTCTTTCGTGAAGAAGGAGATACCTTATTCATTCTGGGCATTTTTCCCAGATGGGACTCTCAATGGACCCAAGGGTTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798431.1
WKPEGATADTSKPKPKPKVAAKALPEMMEEDVIPSLKATLEAQQDISELELSFNENKLEGSFVKKEIPYSFWAFFPDGTLNGPKGFSISSYGRGVSTVEPFLVDEKKPTSKHVVFWVEKRLAAQGIIPVWQDW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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