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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003552`

染色体: Chr03 坐标: 54166946-54167984 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003552`
名称	SmilChr03G003552
描述	uncharacterized SmilChr03G003552
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54166946 - 54167984 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014435`
GeneID	`131014435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014435`
原始查询	`LOC131014435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1442 family protein (DUF1442) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836349]; symbol=AT5G62280; hit=AT5G62280; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF1442 family protein (DUF1442) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836349]; symbol=AT5G62280; hit=AT5G62280; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G62280` (AT5G62280) DUF1442 family protein (DUF1442) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836349] identity=50.2; qcov=1.11; evalue=1.8e-48; confidence=medium
Rice	`Os02g0455400` - identity=30.4; qcov=1.09; evalue=2.27e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07279 (DUF1442)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798398.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057798398.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798398.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057798398.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54167179`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A16,B136,B26,C26,C43,C52,C56,C79
`Chr3:54167260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B93,B94,C19,C54
`Chr3:54167483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:54167524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:54167533`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A1,A20,B100,B115,B120,B139,B140,B2,B20,B36,B54,B68,B83,C14,C17,C29,C30,C35,C5,C59,C75,D8
`Chr3:54167854`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A21,A7,B100,B102,B103,B113,B115,B126,B128,B130,B24,B30,B33,B35,B42,B43,B49,B57,B60,B66,B73,B78,B79,B80,C16,C18,C3,C31,C35,C45,C49,C52,C53,C86,D1,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798398.1

202 aa

101

202

DUF1442

PF07279 DUF1442 4-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798398.1`	Pfam	`PF07279`	DUF1442	Family	4	195	6.1e-20	72.2	Protein of unknown function (DUF1442)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942415.1
TTTCCTTCATTAGTATGACAGGATAATGCATTTGTCTTTTTCTATCTTCCTCCACGCTATATATAGCGTGTTGCACCCCTCCAAAATAAATTTATATATATAATTTCCAAATATTCGAGCATAAAAAAAATGGCTGGCTGGTCTGCTGAAAATGCTACTAACGCTTATCTCAGAGCAATAAAAATGGGAGAGAGAGGCAAGGAGCCCGACACGGCGGAGTTCATCTCGGCCCTCGTGGCCGGCACCAACGCTCGTCTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014435
ATGGCTGGCTGGTCTGCTGAAAATGCTACTAACGCTTATCTCAGAGCAATAAAAATGGGAGAGAGAGGCAAGGAGCCCGACACGGCGGAGTTCATCTCGGCCCTCGTGGCCGGCACCAACGCTCGTCTCATGGTGGTTGCATGCGCCGGTGCCGCCGACTGCACCGTCTTAGCCCTGGTGGCTGCGGCCCACCAAACTGGCGGCCAGGTGGTGTGCATCCTGGGCGGCGGCGCGGAGCTGCAGCTGTCGAGGCGAACGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798398.1
MAGWSAENATNAYLRAIKMGERGKEPDTAEFISALVAGTNARLMVVACAGAADCTVLALVAAAHQTGGQVVCILGGGAELQLSRRTLGESAGDVKFVVGNAEFLLASEYREADCVVVDCRIRNCQEILESAIRVGSTAMVLGYNAFCRGFEFDEAHLLPIGEGLLVRRAAATPPRRRSRWVVKVDKFTGEEHVFRVGSKPKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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