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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003561`

染色体: Chr03 坐标: 54255753-54259914 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003561`
名称	SmilChr03G003561
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54255753 - 54259914 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014442`
GeneID	`131014442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014442`
原始查询	`LOC131014442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 1
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 1
Arabidopsis	`AT4G12080` (AHL1) AT-hook motif nuclear-localized protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826816] identity=53.5; qcov=0.9; evalue=4.26e-85; confidence=high
Rice	`Os08g0118000` (OsAHL1) - identity=56.2; qcov=0.727; evalue=1.42e-66; confidence=high
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798403.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798403.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798403.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798403.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54256180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C13,C27
`Chr3:54256475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:54259002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B37,B63,B83,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798403.1

330 aa

165

330

PCC

PF03479 PCC 124-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798403.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	124	243	1e-35	123.1	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942420.1
TGAAAAGTTGGAATGGCTCCAACGTTAACTTTACAGCTTTAAATAATTAAACCCCATTTTTAAATTCAAAATATTTATCATTTTCCCAAAAATTACCTTTATTTTATATTCAAATTCATTAACTTTGTTATTTTTTAAATGCCACTTATTAAATTTCCAAGACGGACCTGAAACCATTTTCTCAACCATAATTAATACTTTGAATTTTGCAATTTAAATATTGCTTGCTACCTAATTAATTTTCAATATAGTAAAATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014442
ATGGAGGAAAAAGAAGGCATAAATGGTTCAGGGGTCACTGTAAGAGGTGATGAAGCCCCTCAGAGCTACAGGGTGGAGCCAAGAGTTGAAAATTCAGGCAACTTTGGTGGATCAGCCACTCCGCCGGCGCCGGCTCCGCCGCCAAGTGCGGCGGCATCCACGGCGGATGGTAAGAAGAAGAGGGGAAGGCCAAGAAAGTACGCGGCAGATGGCTCTATTGTGGCATTGTCGCCTATGCCGATATCGGCCTCGATTCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798403.1
MEEKEGINGSGVTVRGDEAPQSYRVEPRVENSGNFGGSATPPAPAPPPSAAASTADGKKKRGRPRKYAADGSIVALSPMPISASIPLTGDYPAWKQSGGRPADSFKKKHKLDFANAGSTMTYPVGGSFTPHMITVNSGEDIMMKIISFSQQVSRAICLLAANGAISNVTLRQPNSSGGTLTYEGRFEILSLTGSFMPSDNGVTKSRSGGMSVSLAGPDGRVLGGGLAGMLVAAGPVQIVIGSFLPGGSQPEQKPKKPKYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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