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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003567`

染色体: Chr03 坐标: 54326495-54328615 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003567`
名称	SmilChr03G003567
描述	protein PSK SIMULATOR 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54326495 - 54328615 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014449`
GeneID	`131014449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014449`
原始查询	`LOC131014449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PSK SIMULATOR 3
产物	protein PSK SIMULATOR 3
Arabidopsis	`AT5G51670` (AT5G51670) - identity=52.1; qcov=0.919; evalue=9.87e-155; confidence=high
Rice	`Os03g0858600` - identity=42.8; qcov=0.898; evalue=1.47e-100; confidence=medium
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798411.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798411.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798411.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057798411.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798411.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54326853`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A25,A3,B117,B125,B13,B138,B18,B56,B71,B8,B85,B96,C67
`Chr3:54326876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B17,B65,B95
`Chr3:54326906`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,B48,B60,B85,B90,C59,C71
`Chr3:54326922`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	95	A1,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A24,A25,A3,A9,B10,B101,B107,B117,B122,B126,B129,B132,B134,B135,B137,B138,B139,B15,B17,B18,B27,B31,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B43,B48,B5,B50,B53,B54,B56,B60,B62,B63,B65,B66,B69,B7,B71,B74,B78,B8,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B94,B96,C1,C13,C14,C17,C2,C21,C27,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C37,C4,C47,C48,C49,C50,C55,C59,C63,C65,C67,C71,C76,C80,C81,D1,D11,D6,D7,D8
`Chr3:54326989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B140
`Chr3:54327068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:54327302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:54327427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B140
`Chr3:54327428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr3:54327553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B56,D7
`Chr3:54327763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:54327847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C19,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798411.1

518 aa

259

518

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 98-154 aa PF05003 DUF668 357-444 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798411.1`	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	98	154	2.1e-27	95.7	Domain of unknown function (DUF3475)
`XP_057798411.1`	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	357	444	3.5e-31	108.2	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942428.1
TAGTAAAATCTTATGTTTTTCTTGGTTGAGCAATATCCTAACTAAAATGTCTCGATTCCACCACATATAGTGTGGCTAGTGGAATCCAAATTAGAGCGGATAATCCTTCCCATTTCTTGAAAATGCATTCATCCTTCCTTTCACAGTGCATGTGGGCTTTGTCAACTTTCACAATGATTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTCACACACACAACGCACGCACACATACACACACGCGCGCAAACAAACTCTCACACACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014449
ATGATAGCTTTACAAGAACTCTCCTCCATTATATTATCTTTCTCCTCACTTCCCCTCTTCAATTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTAAATTCTTCATTGATGATTCACCAGTTCCCACTATAGCTCTAAAACCCCTGCAAATCTCCCCTTCCCCAACCAACATCAATAAATCCACAACCATGGCTCTCGAAACATGGTTGATCAAGGTGAAAAGAAGCATCGCCCACAGCTTCGACTCAGTCCGCGCCGCCCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798411.1
MIALQELSSIILSFSSLPLFNYFSLSLSPSKFFIDDSPVPTIALKPLQISPSPTNINKSTTMALETWLIKVKRSIAHSFDSVRAAPPAAAIRKSNVGVLAFEIAGLMSKLLHLWQSLSDKNIARLRGESICLEGVRKIVSNDEGFLLGLACAELAENLRLVAKSVGRISKKCEDASLRCFDRLFEEFANAGRDHHNWLMLSAKEVDSKMKKLDHLVAMTATLHREMDELVALENGLKKSVQGGGKEQKMMELQQKILWQR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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