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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003576`

染色体: Chr03 坐标: 54377800-54379175 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003576`
名称	SmilChr03G003576
描述	uncharacterized SmilChr03G003576
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54377800 - 54379175 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014459`
GeneID	`131014459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014459`
原始查询	`LOC131014459`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835242]; symbol=AT5G51680; hit=AT5G51680; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835242]; symbol=AT5G51680; hit=AT5G51680; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G51680` (AT5G51680) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835242] identity=52.7; qcov=0.231; evalue=7.15e-13; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05097 (DUF688)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798418.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057798418.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057798418.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798418.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798418.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54377997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,D11
`Chr3:54378149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54378169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54378180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C27
`Chr3:54378181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B77,C26,C71
`Chr3:54378208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:54378261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B41,C10,C74
`Chr3:54378306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:54378372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:54378383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54378488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D7
`Chr3:54378564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798418.1

321 aa

160

321

DUF688

PF05097 DUF688 20-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798418.1`	Pfam	`PF05097`	DUF688	Family	20	143	8.1e-08	32.6	Protein of unknown function (DUF688)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942435.1
AATGAGTCAAATTCTTTATTCAAATGGGACATTAGGTAAGCCTAATTTTCAAAGCAAAATGGTTCTGTTAATTAGCAGAGTCCAATGAATTAGTTGAGAAACTACTACTCCATTAATTCTACCAAGTCTATATAAGAGTTTCCCATTCAAGGTAAATTCACAGAATCCATCAATGCAAGAACCCAAAATGGCAGAACCAAACCCTTCCAAGAGCGAGAGGAAGAGAGAGAGACAGCCCATTTCTGTTCCATTCATATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014459
ATGCAAGAACCCAAAATGGCAGAACCAAACCCTTCCAAGAGCGAGAGGAAGAGAGAGAGACAGCCCATTTCTGTTCCATTCATATGGGAAGAAAAACCTGGGATGCCCAAGAAGGACTGGAAACCTTTCAGCCAACCTGTCAAGGCTCCCGCACCACCTGTCAAGTTCGTCGTATCCGTCCCCTTCGGATGGGAAGAGAAGCCGGGGACGCCACTCCCGTTCTTCGTTCAACCTCCGAAGGAACTGCAAATAGTGGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798418.1
MQEPKMAEPNPSKSERKRERQPISVPFIWEEKPGMPKKDWKPFSQPVKAPAPPVKFVVSVPFGWEEKPGTPLPFFVQPPKELQIVAASQANRAFLLPPPKLLTIGYGNWQASSVGNDDERDSEGDESSEPELDACSVDTDDSFCSAKSLLANGLISTAAIASAVPVQQTSLALATTDSRLLQSPGSPASETDSTCSYATGTTSLAGASFLEWLFPLLVSNSNVTNKVEYLEKAPSQKADVQAIDYLHGSNCGQVRRPLLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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