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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003582`

染色体: Chr03 坐标: 54450189-54454316 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003582`
名称	SmilChr03G003582
描述	cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54450189 - 54454316 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014465`
GeneID	`131014465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014465`
原始查询	`LOC131014465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR1
产物	cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR1
Arabidopsis	`AT5G51700` (PBS2) cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835244] identity=65.2; qcov=1; evalue=2.4e-86; confidence=high
Rice	`Os02g0535400` (RAR1) - identity=62.8; qcov=0.994; evalue=5.06e-77; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0042742 (defense response to bacterium); GO:0050832 (defense response to fungus); GO:0051879 (Hsp90 protein binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04968 (CHORD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798440.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798440.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798440.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057798440.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057798440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54450638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54450646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54450718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54450765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798440.1

181 aa

181

CHORD

PF04968 CHORD 1-28 aa PF04968 CHORD 115-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798440.1`	Pfam	`PF04968`	CHORD	Family	1	28	7.3e-35	120.1	CHORD
`XP_057798440.1`	Pfam	`PF04968`	CHORD	Family	115	175	7.3e-35	120.1	CHORD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942457.1
CTCGTATCTCTCTCTCTCATACACACTCTTCTGGTTCTGGGTCTCCGACACATCATTCGAGTCTAGCAAAGAGAGTGAATGGCGAAGGTTCGATGCCAGAGAATCGGATGCGACGCAGTGTTCTCCGAAGAAGACAATCCCGACGGTTCCTGCACTTATCATGCTTCTGTACGCACACCTCTCTCCTCCCTCTTAGTTACTACTGTATCATGATTCCATCGCCGTAGCTCAATCTGTCAGTTGAGAGTTCAATTGTTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014465
ATGAAAGAATGGAGCTGTTGCAAGAAAAGGAGCCATGATTTCAGTTTATTTTTAGAAATTCCTGGTTGCAAGACAGGAAAACATACAACTGAAAAACCTGTGCTCACAAAGCCTGCTGCAGCTCAAAAGAAGCCAGTTTCTGTTCCAACACCCCTGGCTGATTCCTCTTCAAAAGATACGTGTCCTAGGTGCCGCCAAGGATTCTTCTGTTCTGACCATGGTTCACACAACCAAGAAACGAATCCAAAATCTGTAGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798440.1
MKEWSCCKKRSHDFSLFLEIPGCKTGKHTTEKPVLTKPAAAQKKPVSVPTPLADSSSKDTCPRCRQGFFCSDHGSHNQETNPKSVVNANNESSLDIQEPKPPQPKKIIDINQPQICRNKGCGKSFKEKDNYDAACEYHPGPPVFHDRMRGWKCCDVHVKEFDEFMSIPPCAKGWHNADPAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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