Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003607`

染色体: Chr03 坐标: 54711256-54713883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003607`
名称	SmilChr03G003607
描述	uncharacterized SmilChr03G003607
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54711256 - 54713883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014484`
GeneID	`131014484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014484`
原始查询	`LOC131014484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829708]; symbol=DAW1; hit=AT4G35560; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829708]; symbol=DAW1; hit=AT4G35560; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G35560` (DAW1) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829708] identity=41; qcov=1.08; evalue=1.12e-48; confidence=medium
Rice	`Os04g0564700` - identity=37.9; qcov=1.02; evalue=2.67e-35; confidence=medium
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0017157 (regulation of exocytosis); GO:0019905 (syntaxin binding); GO:0045159 (myosin II binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798460.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798460.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057798460.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057798460.1`
5	Spindle pole body	Spindle pole body	0.20000	`XP_057798460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54711431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B118,B131,B136,C57
`Chr3:54711489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B131,B136,C57
`Chr3:54711495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:54711497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C57
`Chr3:54711510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B4,C1,C27,C52
`Chr3:54711625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:54711693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B45
`Chr3:54711697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C21,C38
`Chr3:54711828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr3:54711847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B128,D4,D8
`Chr3:54711848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr3:54711964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942477.1
CTCTCTCTATTGCTATGCACTGAGAAATCAGTGTATGCATTTTCCTTATTGCATTTAGTCCAGGTATACTCGCATCCGGCTGTCATGTAATCAACGTAACATATTCAGAAAGGTTGACTAAATCTGCTCTTACGTATCTACAGGGTGTTAAGAAAGTGATGTACAAAAAGAAATTCAGTTCTCCTTGTTACTCGGCATCAACGTTTGGCTCTCCAGATGTCGGACTTATACTTGTTTTTGCCAGTGGAAAAATCGAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014484
ATGTACAAAAAGAAATTCAGTTCTCCTTGTTACTCGGCATCAACGTTTGGCTCTCCAGATGTCGGACTTATACTTGTTTTTGCCAGTGGAAAAATCGAGATTAGATCCCTGCCAGAATTGTCTCTAGTGAAAGAAAGTTCAATAAGAGTGCTCACATTTTCGACTTCTAGACCTTTCTCCGTTTCTGACATTGTAGTGTCGTCATCCCTTGATGGCGAAATCATCATTGTTAACGGCAATCAGGAGTTAGTTTTCGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798460.1
MYKKKFSSPCYSASTFGSPDVGLILVFASGKIEIRSLPELSLVKESSIRVLTFSTSRPFSVSDIVVSSSLDGEIIIVNGNQELVFVSTLLHEAYRFVDSVSMVLKKNLVNAQGLIYTPPVKEKKKGIFASVIKDNKSSKSRNGHEVETEDCRQSIEELCTIFSTSNFAREIESEEKKIMNEELDIDDIEIEEPKERARVMAGLNRQNITNTFQAIKGKLKHTKVKSEKAAGVNEEEKSGGAVDQIKKKYGYASSSQFHAW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器