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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002225`

染色体: Chr01 坐标: 38724949-38725732 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002225`
名称	SmilChr01G002225
描述	probable calcium-binding protein CML29
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38724949 - 38725732 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014500`
GeneID	`131014500`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014500`
原始查询	`LOC131014500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML29
产物	probable calcium-binding protein CML29
Arabidopsis	`AT1G66410` (CAM4) calmodulin 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842959] identity=32.6; qcov=0.94; evalue=5.99e-21; confidence=low
Rice	`Os06g0691600` (OsCML29) - identity=40.5; qcov=1.02; evalue=1.44e-26; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0030234 (enzyme regulator activity)
KEGG	-
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014500

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798476.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798476.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798476.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798476.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798476.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38725323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798476.1

150 aa

150

EF-hand_5

EF-hand_6

EF-hand_1

EF-hand_7

EF-hand_8

EF-hand_5

PF13202 EF-hand_5 17-38 aa PF13405 EF-hand_6 17-45 aa PF00036 EF-hand_1 18-44 aa PF13499 EF-hand_7 18-71 aa PF13833 EF-hand_8 99-142 aa PF13202 EF-hand_5 129-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798476.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	17	38	2.2e-09	37.1	EF hand
`XP_057798476.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	17	45	7.4e-14	50.8	EF-hand domain
`XP_057798476.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	18	44	5.9e-14	51.2	EF hand domain
`XP_057798476.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	18	71	2.9e-15	57.1	EF-hand domain pair
`XP_057798476.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	99	142	4.6e-12	46.2	EF-hand domain pair
`XP_057798476.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	129	143	2.2e-09	37.1	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942493.1
CACATTATATACCTTCTCCACTAAAGCTGGAATAGAGATATCCATAGCATAAGCATCTATACTCAACTATCTCAAAGTGGCAGCATATATTCCTCTCCTCTCTCTTGTATATATATACATATGCATTAATTGTAGGCCTTAGGCATCATGGGTTCCATCTCTGTGGACGTTGAGACACTCAACCATATCCTAGGGCTGGTGGAGGCCTTCCGAGCCTTCGACTCCGACAACGATGGCTGTATCAACGTCCAAGAGCTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014500
ATGGGTTCCATCTCTGTGGACGTTGAGACACTCAACCATATCCTAGGGCTGGTGGAGGCCTTCCGAGCCTTCGACTCCGACAACGATGGCTGTATCAACGTCCAAGAGCTCGGAGGGATCATGTCGTCGCTCGGGTACAACGTGACCGAGCAGGACGTACAAGCCATGATGCACAAGGGCGACGGGCAGCTGCTCAGCCTGCCCGACTTCATAGACATCAACACCGAGAATCTCCAACTCAGCGGTCTCAGCGCCCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798476.1
MGSISVDVETLNHILGLVEAFRAFDSDNDGCINVQELGGIMSSLGYNVTEQDVQAMMHKGDGQLLSLPDFIDINTENLQLSGLSALKTAIQALELHQHDVLTGEELRRAVGNLGVELSLDDCQQIVASMDGDGDGAISVDELNLILNCLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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