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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003662`

染色体: Chr03 坐标: 55450913-55454122 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003662`
名称	SmilChr03G003662
描述	protein HOTHEAD-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55450913 - 55454122 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014521`
GeneID	`131014521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014521`
原始查询	`LOC131014521`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HOTHEAD-like
产物	protein HOTHEAD-like
Arabidopsis	`AT5G51950` (AT5G51950) Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835270] identity=55.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0573100` (HTH1) - identity=53.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016614 (oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00732 (GMC_oxred_N); PF05199 (GMC_oxred_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057798495.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798495.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057798495.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798495.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55451312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:55451327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B42,B43,B44,B61
`Chr3:55451717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B58,C31,C83
`Chr3:55451794`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A11,A13,A15,A16,A18,A21,A24,A25,A5,A7,A8,B100,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B127,B136,B140,B21,B26,B29,B35,B37,B46,B5,B50,B53,B55,B57,B60,B63,B64,B66,B69,B70,B71,B75,B8,B83,B84,B87,B9,B90,B92,B97,B98,B99,C13,C14,C17,C2,C20,C24,C25,C26,C32,C36,C42,C43,C45,C48,C52,C58,C6,C60,C62,C68,C69,C7,C70,C72,C79,C8,C80,C83,C84,D11,D3,D4,D6
`Chr3:55451818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A24,A8,B82,C15
`Chr3:55451980`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A13,B119,B12,B136,B140,B26,B31,B55,B69,B83,B87,C1,C14,C26,C43,C48,C52,C56,C79
`Chr3:55451998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:55452035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:55453238`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:55453238`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:55453259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:55453387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B58,C31,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798495.1

569 aa

284

569

GMC_oxred_N

GMC_oxred_C

PF00732 GMC_oxred_N 47-319 aa PF05199 GMC_oxred_C 408-552 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798495.1`	Pfam	`PF00732`	GMC_oxred_N	Domain	47	319	1.2e-18	68.4	GMC oxidoreductase
`XP_057798495.1`	Pfam	`PF05199`	GMC_oxred_C	Domain	408	552	8e-27	95.2	GMC oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942512.1
TCTACTAGTACTATTGAATTCGTGAATGTGATTCATATTTTTTAATTCTGAGAACATGGCGGCTTCCCGAAAGTCAATTCTCATTGTTGCAGTCCCCTTATGGATTTTCTTCTTGATCGTTTATTCTTCTGCAGATAAAGCTCCATACACTTCATTTGCCAAAAACGCAGCATCAGCTCCGTTGATAGGTTACTACGACTACGTAATCATCGGAGGCGGAACCGCCGGATGCCCACTGGCAGCGACGCTCTCCGCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014521
ATGGCGGCTTCCCGAAAGTCAATTCTCATTGTTGCAGTCCCCTTATGGATTTTCTTCTTGATCGTTTATTCTTCTGCAGATAAAGCTCCATACACTTCATTTGCCAAAAACGCAGCATCAGCTCCGTTGATAGGTTACTACGACTACGTAATCATCGGAGGCGGAACCGCCGGATGCCCACTGGCAGCGACGCTCTCCGCCTCCGCAAAAGTACTACTCCTCGAGAGGGGCGGCCTTCCTTACGACAACCCCGACGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798495.1
MAASRKSILIVAVPLWIFFLIVYSSADKAPYTSFAKNAASAPLIGYYDYVIIGGGTAGCPLAATLSASAKVLLLERGGLPYDNPDVVHIAGFVKLLTDPSPYSAAQLFISTDGVFNHRARVLGGGSAINAGFYTRASRDYVNQVGWDPRLVNESYEWVERKVAFRPRLRQWQAAVREGLLDAGVLPDNGFTYEHLHGTKIGGTIFDEDGVRHTAADLLEYAQPNNITVYLHAAVHQILFTTSPGQRPKANGVLFKDSNGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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