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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003661`

染色体: Chr03 坐标: 55427047-55429722 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003661`
名称	SmilChr03G003661
描述	protein HOTHEAD-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55427047 - 55429722 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014523`
GeneID	`131014523`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014523`
原始查询	`LOC131014523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HOTHEAD-like
产物	protein HOTHEAD-like
Arabidopsis	`AT5G51950` (AT5G51950) Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835270] identity=55.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0573100` (HTH1) - identity=52; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016614 (oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00732 (GMC_oxred_N); PF05199 (GMC_oxred_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014523

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057798497.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057798497.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057798497.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798497.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55427533`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A10,B112,C58,C85
`Chr3:55427533`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A10,B112,C58,C85
`Chr3:55428096`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr3:55428096`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr3:55428102`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C14
`Chr3:55428102`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C14
`Chr3:55429080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:55429081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B99,D11
`Chr3:55429371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:55429589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B59
`Chr3:55429611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D6
`Chr3:55429699`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A22,B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798497.1

558 aa

279

558

GMC_oxred_N

GMC_oxred_C

PF00732 GMC_oxred_N 64-337 aa PF05199 GMC_oxred_C 399-543 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798497.1`	Pfam	`PF00732`	GMC_oxred_N	Domain	64	337	3.2e-20	73.6	GMC oxidoreductase
`XP_057798497.1`	Pfam	`PF05199`	GMC_oxred_C	Domain	399	543	3.4e-27	96.4	GMC oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942514.1
GGCATCTAGTACATGTACATCATCATCTCTTCATTGGTCACATCTCTTAATTCTCAAAATATGGCAGCTTCCCCAAAGTCAATTCAAAATATTGTTACATGTTTCTTAGGTGTCTTCTTCTTGATCGACTCGTCCTCTGCAGAGACAGCTCCATACACCTCCTTTGCGAAAAAAGCGACATCAGCTCCATCGAGAGGGTACTACGACTACATAATCATCGGCGGCGGAACCGCCGGATGCCCACTGGCAGCAACGCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014523
ATGTACATCATCATCTCTTCATTGGTCACATCTCTTAATTCTCAAAATATGGCAGCTTCCCCAAAGTCAATTCAAAATATTGTTACATGTTTCTTAGGTGTCTTCTTCTTGATCGACTCGTCCTCTGCAGAGACAGCTCCATACACCTCCTTTGCGAAAAAAGCGACATCAGCTCCATCGAGAGGGTACTACGACTACATAATCATCGGCGGCGGAACCGCCGGATGCCCACTGGCAGCAACGCTCTCGGCCTCCGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798497.1
MYIIISSLVTSLNSQNMAASPKSIQNIVTCFLGVFFLIDSSSAETAPYTSFAKKATSAPSRGYYDYIIIGGGTAGCPLAATLSASAKVLLLERGGLPYDNPNVVHATGFLRLLTDPSPDSAAQLFISNDGVFNHRARVLGGGSAVNAGFYTRASSDYVNRVGWAPRRVKASYEWVERKVAFPPKLRKWQAAVRDGLLDAGVLPDNGFTYEHLHGTKIGSTIFDQNGIRHTAADLLEYAHPNNITVYFHATVHQILFTTSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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