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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003654`

染色体: Chr03 坐标: 55368761-55370036 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003654`
名称	SmilChr03G003654
描述	uncharacterized SmilChr03G003654
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55368761 - 55370036 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014525`
GeneID	`131014525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014525`
原始查询	`LOC131014525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0692401; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os07g0692401; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G01710` (AT5G01710) methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831693] identity=49.8; qcov=0.728; evalue=1.68e-83; confidence=high
Rice	`Os07g0692401` - identity=52.3; qcov=0.699; evalue=9.05e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25276 (DUF7870)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798499.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057798499.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798499.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798499.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55369034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr3:55369108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B60
`Chr3:55369123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B60
`Chr3:55369168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C54
`Chr3:55369184`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr3:55369184`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr3:55369206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:55369371`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr3:55369371`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B32
`Chr3:55369865`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B22,B59
`Chr3:55369865`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B22,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798499.1

345 aa

172

345

DUF7870

PF25276 DUF7870 111-190 aa PF25276 DUF7870 249-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798499.1`	Pfam	`PF25276`	DUF7870	Domain	111	190	1.7e-32	113.6	Domain of unknown function (DUF7870)
`XP_057798499.1`	Pfam	`PF25276`	DUF7870	Domain	249	345	1.7e-32	113.6	Domain of unknown function (DUF7870)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942516.1
ACCCATTTTGAATTTACGTGGAAAGCGTAAATTGTATCCCCCAAAGTGAGGAATTACTGTATCTCAAAATGTCCTTAAATTTGACTTTTCATGAGCTCGAATGCTCGATCACATACATAGATAGACACGCACACACATTGCGTTCCAGTGCTCACCAAATCTCACCTGTCCCACTAATCCCATCTCTCTCTCTCTCTCATACAGACATTCTCGTCCGAGTGATGAATCCAAGAAAACCATATCCGGCACCTTCCCTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014525
ATGTCCTTAAATTTGACTTTTCATGAGCTCGAATGCTCGATCACATACATAGATAGACACGCACACACATTGCGTTCCAGTGCTCACCAAATCTCACCTGTCCCACTAATCCCATCTCTCTCTCTCTCTCATACAGACATTCTCGTCCGAGTGATGAATCCAAGAAAACCATATCCGGCACCTTCCCTGAAAGTCATCGTGTACGGCATGCCCCTCATCTTCCTCCTCCTCACCATGGCCGCCATGTTCAAGGACAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798499.1
MSLNLTFHELECSITYIDRHAHTLRSSAHQISPVPLIPSLSLSHTDILVRVMNPRKPYPAPSLKVIVYGMPLIFLLLTMAAMFKDKFYTNTLTVYAAREQHCDVPSSVIGELEPLIAEEPLEVWEGLGKEESHIKYLPSMIDLAAKRRFIYIDLGARDYESSIGSWFEKQYPKQNKTFQIYAVEADAAFHGQYQSRPGVTLLPYAAWVRNETVVFGSKPIVVGSKVWRMRPFGRIEGQQAAEDGMSAVVRVPAFDFVDWL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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