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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003656`

染色体: Chr03 坐标: 55398768-55401741 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003656`
名称	SmilChr03G003656
描述	urease accessory protein F
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55398768 - 55401741 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014526`
GeneID	`131014526`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014526`
原始查询	`LOC131014526`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	urease accessory protein F
产物	urease accessory protein F
Arabidopsis	`AT1G21840` (UREF) urease accessory protein F [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838786] identity=68.3; qcov=0.921; evalue=1.85e-117; confidence=high
Rice	`Os02g0168000` (UREF) - identity=71.2; qcov=0.925; evalue=1.56e-119; confidence=high
GO	GO:0006807 (GO:0006807); GO:0016151 (nickel cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF01730 (UreF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014526

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798500.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798500.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057798500.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057798500.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55399414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B44,B61,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798500.1

240 aa

120

240

UreF

PF01730 UreF 50-197 aa

XP_057798501.1

240 aa

120

240

UreF

PF01730 UreF 50-197 aa

XP_057798502.1

240 aa

120

240

UreF

PF01730 UreF 50-197 aa

XP_057798503.1

240 aa

120

240

UreF

PF01730 UreF 50-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798500.1`	Pfam	`PF01730`	UreF	Family	50	197	2e-27	97.1	UreF
`XP_057798501.1`	Pfam	`PF01730`	UreF	Family	50	197	2e-27	97.1	UreF
`XP_057798502.1`	Pfam	`PF01730`	UreF	Family	50	197	2e-27	97.1	UreF
`XP_057798503.1`	Pfam	`PF01730`	UreF	Family	50	197	2e-27	97.1	UreF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942520.1
AATCAGAACTTCTCGGCCCAGCCCCCATCTCCAAATCGGAGTCCTCCCCCACCCGCTTATTGAGCCACTTCCGGCCATCCACCTCCAGGCTCGCCCCCTCCCCCACCCGAAATCCCTCTCAGACCCCTACCCCACCCGAAATCCCTCAGCCAAGCAGCAAGAAGAAGGTGCGGTCTCGGACTTGAGCAGCTTCTCAGGCTCAGCGGTCCGGCCGTCCACCTGACCACCTCTGTTGTGGCGTTGACTGAACCACTCCATCT...

XM_057942517.1
TCAGAACTTCTCGGCCCAGCCCCCATCTCCAAATCGGAGTCCTCCCCCACCCGCTTATTGAGCCACTTCCGGCCATCCACCTCCAGGCTCGCCCCCTCCCCCACCCGAAATCCCTCTCAGACCCCTACCCCACCCGAAATCCCTCAGCCAAGCAGCAAGAAGAAGGTGCGGTCTCGGACTTGAGCAGCTTCTCAGGCTCAGCGGTCCGGCCGTCCACCTGACCACCTCTGTTGTGGCGTTGACTGAACCACTCCATCTCG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131014526
ATGGAGGGCTTGGGGGATGCAAATGCTAGATGTTTATCAACAAGTTTTCCCCAGCTGTGGAGTCAATGGCAGCTATTAGATTCTATACTTCCTACTGGGGGCTTTGCTCATTCTTTTGGTCTCGAGGCAGCTATGCAAGCTCGCCTGGTCACTACAACCGATGAACTAAAAACATACGTGATCCATGTATTGGAGAATGTAGGAAGCCTACTTCTACCTTTCATCTGTGCCACAACAATGTCACCAGATGCACAGACATG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057798500.1
MEGLGDANARCLSTSFPQLWSQWQLLDSILPTGGFAHSFGLEAAMQARLVTTTDELKTYVIHVLENVGSLLLPFICATTMSPDAQTWHSLDRLLNAMLTNEVGRKASTAQGSALMRVAASVFSEIPCLKMMRGEALGSGDVYFHHAPVFGLVCGLLGFDPETTQKAYMFVTMRDIISAATRLNLLGPLGAAVLQHQVAPVAESLSTKWMNRGVDEACQTCPLLDTVQGCHSYLFSRLFCS

XP_057798501.1
MEGLGDANARCLSTSFPQLWSQWQLLDSILPTGGFAHSFGLEAAMQARLVTTTDELKTYVIHVLENVGSLLLPFICATTMSPDAQTWHSLDRLLNAMLTNEVGRKASTAQGSALMRVAASVFSEIPCLKMMRGEALGSGDVYFHHAPVFGLVCGLLGFDPETTQKAYMFVTMRDIISAATRLNLLGPLGAAVLQHQVAPVAESLSTKWMNRGVDEACQTCPLLDTVQGCHSYLFSRLFCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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