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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003688`

染色体: Chr03 坐标: 55772633-55776823 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003688`
名称	SmilChr03G003688
描述	serine/arginine-rich splicing factor RS40-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55772633 - 55776823 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014554`
GeneID	`131014554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014554`
原始查询	`LOC131014554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor RS40-like
产物	serine/arginine-rich splicing factor RS40-like
Arabidopsis	`AT4G25500` (RS40) arginine/serine-rich splicing factor 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828654] identity=62.4; qcov=0.68; evalue=2.07e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0122800` (P0575F10.6-1) - identity=62.4; qcov=0.645; evalue=5.88e-81; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0016607 (nuclear speck)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798539.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057798539.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057798539.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057798539.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55775546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:55775934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:55775989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:55776457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798539.1

416 aa

208

416

RRM_1

PF00076 RRM_1 4-62 aa PF00076 RRM_1 97-159 aa

XP_057798541.1

416 aa

208

416

RRM_1

PF00076 RRM_1 4-62 aa PF00076 RRM_1 97-159 aa

XP_057798542.1

375 aa

188

375

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798539.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	4	62	2.7e-30	104.7	RNA recognition motif
`XP_057798539.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	97	159	2.7e-30	104.7	RNA recognition motif
`XP_057798541.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	4	62	2.7e-30	104.7	RNA recognition motif
`XP_057798541.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	97	159	2.7e-30	104.7	RNA recognition motif
`XP_057798542.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	118	1.6e-16	60.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942556.1
TGACCAATAAGCCCCTTGTCCAGATATAAATATCTAAGCACATTTAGCTGACGATTTCTTAGTTGAAGTAAGAGATATTTTCCTTTTCCTCGCGTCGAGAGCTCGCAATCTCATCTACTAGGGTTTCGATTTTCTCCAGAGGTAATAGGGTATCACAATTGAGGTGCAATGAGACCAATTTTCTGTGGAAATTTTGAGTATGATGCTCGGCAGTCTGATCTTGAGAGACTCTTCAGAAGATATGGGCAAGTCGATAGGGT...

XM_057942558.1
AAGTAAGAGATATTTTCCTTTTCCTCGCGTCGAGAGCTCGCAATCTCATCTACTAGGGTTTCGATTTTCTCCAGAGGTGCGGAATTTCGAGATTTTATTGTACAATATTCATCATTTACGCCGATCTGTGAGGCTTTTCTGCTGTCGGTTTCGATCTCGCTATGTCGTTCTATATATTATTGATTTATTGGTAATAGGGTATCACAATTGAGGTGCAATGAGACCAATTTTCTGTGGAAATTTTGAGTATGATGCTCGGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131014554
ATGAGACCAATTTTCTGTGGAAATTTTGAGTATGATGCTCGGCAGTCTGATCTTGAGAGACTCTTCAGAAGATATGGGCAAGTCGATAGGGTCGATATGAAGTCTGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAGGATGAAAGAGATGCGGAGGATGCAATTCGTGCACTTGACCGAATTGAATTTGGTAGGAAGGGGCGTAGGCTTCGTGTTGAGTGGACCAAGCAAGAACGAAGTAGCCGGCGGCCAGAAAGCTCCAAAAAATC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057798539.1
MRPIFCGNFEYDARQSDLERLFRRYGQVDRVDMKSGFAFVYMEDERDAEDAIRALDRIEFGRKGRRLRVEWTKQERSSRRPESSKKSSSNTRPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNIRVRRNFAFIQFESLEDATKALDATNMSKLLDRVITVEFAMKDDDDRRNGNSPDHVRDRSPRRGYDRVRSQSPYRRERDSPDYGHNRGRSPSPYRRERASPDYARGSSQSPNRKERGSPNRKVRGSPDRKERESSD...

XP_057798541.1
MRPIFCGNFEYDARQSDLERLFRRYGQVDRVDMKSGFAFVYMEDERDAEDAIRALDRIEFGRKGRRLRVEWTKQERSSRRPESSKKSSSNTRPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNIRVRRNFAFIQFESLEDATKALDATNMSKLLDRVITVEFAMKDDDDRRNGNSPDHVRDRSPRRGYDRVRSQSPYRRERDSPDYGHNRGRSPSPYRRERASPDYARGSSQSPNRKERGSPNRKVRGSPDRKERESSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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