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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003703`

染色体: Chr03 坐标: 55979942-55982925 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003703`
名称	SmilChr03G003703
描述	protein IQ-DOMAIN 24-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55979942 - 55982925 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014569`
GeneID	`131014569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014569`
原始查询	`LOC131014569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 24-like
产物	protein IQ-DOMAIN 24-like
Arabidopsis	`AT5G07240` (IQD24) IQ-domain 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830615] identity=39.1; qcov=0.919; evalue=4.45e-39; confidence=medium
Rice	`Os04g0569900` - identity=39.8; qcov=1.07; evalue=3.39e-40; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057798562.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798562.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798562.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057798562.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55980342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:55980423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B78,C33
`Chr3:55981644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:55982146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B29,B70,C24
`Chr3:55982241`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B105,B127,B131,B140,B2,B81,C10,C11,C13,C36,C39,C69,C7
`Chr3:55982242`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B105,B127,B131,B140,B2,B81,C10,C11,C13,C36,C39,C69,C7
`Chr3:55982278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:55982350`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr3:55982350`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr3:55982426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798562.1

406 aa

203

406

DUF4005

PF00612 IQ 101-120 aa PF00612 IQ 126-140 aa PF13178 DUF4005 319-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798562.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	101	120	1.8e-07	31.0	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057798562.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	126	140	1.8e-07	31.0	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057798562.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	319	390	2.7e-11	44.7	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942579.1
GGAGGAGCAGAAAGCGTGATTACCTGTTAATTGTCGTCTATTCAAAACCGCGAAGGGTCCCAACATCCAACCACCACGCCGCGCGTCGCCCCCACCCGCCGCCTGGGCGCGCGTGCAACACTATCCCAATAAATATAGGCATCGCTGCTCCCATCAAATGCTCCCAAGAAAAATGTTGAAACAACACACAGCAGCTTCTCCACTCGCCATAATGAGACATGGGTAAAACTGCCAAGTGGTTGCGCTCACTCCTAAGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014569
ATGGGTAAAACTGCCAAGTGGTTGCGCTCACTCCTAAGCTCCAAGAAGTCCGAGCAGCCGTCGAGGGAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGGTGGGCCTTCTCGAAATCCGCTGCTTATAAGTTGAAGAATGAGGACCCATATCTTGATGCTAACAAGCATGCAATAGCCGTCGCGGCGGCCACGGCGGCGGTAGCTGAGGCTGCTCTTGCTGCCGCACACGCCGCGGCTCAGGTGGTCAGGCTCACCACTGCCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798562.1
MGKTAKWLRSLLSSKKSEQPSREKEKKKKSRWAFSKSAAYKLKNEDPYLDANKHAIAVAAATAAVAEAALAAAHAAAQVVRLTTAAGSGRNVPAYDRRRVAAVTKIQSAFRAYLARRALKALKGLVKLQALVRGHIVRKQSADLLHRMQAMARIQARASSHRSYVSDSCKANFRFSNYQSSGAVNPRNYHQWSDTGKHGGYITTKPSRTSNIGSRDMASNWLNHWIEQYSWNNRRGDDDERSDKILEVDTWKPRESTTRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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