当前解析结果
SmilChr03G003718| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003718 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003718 |
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 56198069 - 56199905 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014582 |
|---|---|
| GeneID | 131014582 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014582 |
| 原始查询 | LOC131014582 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 2 |
| 产物 | probable membrane-associated kinase regulator 2 |
| Arabidopsis | AT1G64080 (MAKR2)membrane-associated kinase regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842712] identity=32.1; qcov=0.991; evalue=5.46e-18; confidence=low |
| Rice | Os01g0226200- identity=29.5; qcov=1.15; evalue=9.14e-17; confidence=low |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF30362 (MAKR5_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014582 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057798573.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057798573.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057798573.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798573.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798573.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:56198558 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr3:56198775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C77,D6 |
Chr3:56198778 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C30 |
Chr3:56198926 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B46,B60,B63,B83,C23 |
Chr3:56199233 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:56199461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C45 |
Chr3:56199464 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B10 |
Chr3:56199464 |
C |
CAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798573.1PF30362
MAKR5_C 36-305 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798573.1 |
Pfam | PF30362 |
MAKR5_C | Domain | 36 | 305 | 7.8e-71 | 239.8 | Membrane-associated kinase regulator 5 helix |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。