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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003732`

染色体: Chr03 坐标: 56355808-56360808 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003732`
名称	SmilChr03G003732
描述	plastidial pyruvate kinase 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56355808 - 56360808 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014594`
GeneID	`131014594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014594`
原始查询	`LOC131014594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastidial pyruvate kinase 2
产物	plastidial pyruvate kinase 2
Arabidopsis	`AT5G52920` (PKP-BETA1) plastidic pyruvate kinase beta subunit 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835369] identity=77.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0571200` - identity=76; qcov=0.856; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00224 (PK); PF02887 (PK_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798592.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057798592.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798592.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798592.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56356062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B20,B68
`Chr3:56356096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B20,B68
`Chr3:56356895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:56358260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B95
`Chr3:56358384`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A14,A15,A16,A7,B104,B120,B136,B139,B21,B31,B38,B50,B52,B69,B72,C17,C28,C55
`Chr3:56358450`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A5,A7,A9,B10,B100,B103,B104,B109,B110,B111,B112,B113,B117,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B136,B137,B139,B14,B140,B17,B18,B2,B21,B24,B26,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B35,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B49,B50,B52,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B82,B83,B85,B9,B91,B92,B94,B96,B97,B99,C1,C11,C13,C16,C17,C18,C2,C20,C23,C26,C28,C29,C30,C32,C34,C37,C40,C41,C42,C43,C47,C5,C50,C51,C52,C54,C60,C61,C65,C67,C68,C69,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C81,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D2,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr3:56358912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B74
`Chr3:56358918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:56358938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:56359270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:56359721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B139
`Chr3:56359986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798592.1

561 aa

280

561

PK_C

PF00224 PK 92-412 aa PF02887 PK_C 449-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798592.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	92	412	8.5e-111	370.9	Pyruvate kinase, barrel domain
`XP_057798592.1`	Pfam	`PF02887`	PK_C	Domain	449	542	9.3e-20	71.6	Pyruvate kinase, alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942609.1
GCTAATTGCCAACCGTTGTTGAGCTAACTGTTGGGGTAGTGACCAGCCTCCAGTTTTCATTCGATACAAACAAGAAGCCGATCCTCCAAAATCATCGACGATTTCTCCAATCTGCCTCTTAATTTATACTCGCGCCTCCTCGTTCTCTGTCCCTCACTTCCTCTCTCTACCTATCTCCACCTTTTTTACACGAGGTTGGTTGTTGCTGCAATGGCACAGACGGCTGCGACGGGGTTGATTCACGGCGCAGTTGCGGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014594
ATGGCACAGACGGCTGCGACGGGGTTGATTCACGGCGCAGTTGCGGCGAATCCGGCCTCTGGATCTCATCGGATCCGTGTGGACAAGCTGAGACCAATTCATGGCTTTGAAGGGAAGGTTTTGGGACGAACCGAGAAGAAGAGCCACAGCGGAGTCAGCGCCGTGCGCTCTGAACTGCAAGTGATTCCGGCAGAAGAGAAAAATCAATATTTACAAGGGATTCCACAACCTGGCGGAACATCAGCATCTATATGGTCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798592.1
MAQTAATGLIHGAVAANPASGSHRIRVDKLRPIHGFEGKVLGRTEKKSHSGVSAVRSELQVIPAEEKNQYLQGIPQPGGTSASIWSKPTVSRKTKIVCTIGPSTNTREMIWKLAEAGMNVARLNMSHGDHASHQKVIDLVKEYNAQSKDNVIAIMLDTKGPEVRSGDLPQPIPLTTGQEFTFTIRRGVGTTDCVSVNYDDFVNDVEAGDMLLVDGGMMSFLVKSKTKDSVKCEVIDGGELMSRRHLNVRGKSATLPSITE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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