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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003733`

染色体: Chr03 坐标: 56361768-56364596 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003733`
名称	SmilChr03G003733
描述	probable polygalacturonase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56361768 - 56364596 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014595`
GeneID	`131014595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014595`
原始查询	`LOC131014595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase
产物	probable polygalacturonase
Arabidopsis	`AT3G48950` (AT3G48950) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824056] identity=65.9; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0106800` - identity=57.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057798593.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057798593.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057798593.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798593.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56362014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B10,C30,D1
`Chr3:56362029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:56362173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:56362193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C60
`Chr3:56362195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:56362227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B5,B64
`Chr3:56362386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C20
`Chr3:56362393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr3:56362415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B54,C31,C84
`Chr3:56362426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:56362430`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B29,C31,C84
`Chr3:56362430`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B29,C31,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798593.1

468 aa

234

468

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 129-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798593.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	129	410	1.2e-39	137.0	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942610.1
AAAGAAATGGACGTGCAAAATCTGATTAATTTTACTTTCCACTTATAACGAAGAGAAACAAAGATAATTCCTCCATTCACCAAAATGTGGTCTTTTATTATTTTAATTCATCCATAATAGCAGCTATTTGAGGCTTAACAGGAGGAGATAAGACATCAGAAGGAGGAGATAAGATAGAAAGACGAGCATTACTGACAGAAAATTTCATCGGTTATGGAGAAAGTGTTGGGCTGCATTCTACTAGGAATGCTGTTTCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014595
ATGGAGAAAGTGTTGGGCTGCATTCTACTAGGAATGCTGTTTCTGAATACAGCAGAATCCGGAAATGACAATTCTGTGAAAGAGCAAATCCCATATTCGGCAATAAACTGTCGCAAACACAGTGCATATTTGACAGATTTCGGAGGCAAAGGAGATGGAAAAACTTTAAACACAGCAGCATTTAAGGCAGCCATTGCTAACCTGAGCAAGCTTGCATCCGACGGTGGGGCGTTGCTCGTCGTTCCCCCCGGGAAATGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798593.1
MEKVLGCILLGMLFLNTAESGNDNSVKEQIPYSAINCRKHSAYLTDFGGKGDGKTLNTAAFKAAIANLSKLASDGGALLVVPPGKWLTGSFNLASHFTLYIHQKAVILASQEESDFPLIDPLPSYGQGREAQGKRFSSLIVGTNLTDVVITGGNGTIDGQGAIWWQKFKAKKLKNTRPYLIEILHSEQVQISDLTLTNSPSWHVHPTYCTNVTIERLTILAPIDVPNTDGINPDSCTDTRILDSYVVSGDDCIAVKSGWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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