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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003761`

染色体: Chr03 坐标: 56743824-56747497 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003761`
名称	SmilChr03G003761
描述	probable WRKY transcription factor 30
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56743824 - 56747497 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014620`
GeneID	`131014620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014620`
原始查询	`LOC131014620`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 30
产物	probable WRKY transcription factor 30
Arabidopsis	`AT5G24110` (WRKY30) WRKY DNA-binding protein 30 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832476] identity=39.8; qcov=0.739; evalue=3.91e-47; confidence=medium
Rice	`Os08g0386200` (OsWRKY69) - identity=41.8; qcov=0.595; evalue=2.43e-43; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798625.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798625.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798625.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798625.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56744093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:56744100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B8,C33,C38
`Chr3:56744120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:56744166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:56744272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C81
`Chr3:56744529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B123,B14,B50
`Chr3:56746312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:56746959`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A16,B123,B14,B50
`Chr3:56746959`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A16,B123,B14,B50
`Chr3:56746961`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A16,B123,B14,B50
`Chr3:56746961`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A16,B123,B14,B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798625.1

326 aa

163

326

WRKY

PF03106 WRKY 138-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798625.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	138	198	9.7e-26	90.5	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942642.1
AACTTTCAAACCCAACACTTCCTAGTTCCTGCTACTATCATTCTTCACTTTTCCCCTACCATCTATATATATATATATATACTCACACCATACCCTCAACACATATATAACGCCTTCTCCCTCTATATCTCCAAAACCCTTCAGTTTATTTATCTATATATCAAAAACATTGTTTCCTGAGTTGCATGGTTTCAGAAACAAAGCTGCTAAACTTGTCTCCGCCGGTGGGAGGAAGATTAATTCAGCTCAATTTCAACATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014620
ATGTCATCACCTCCCTTTTCCGGGAAAGGAATGGAGAATTTTCCGTCGGATTCGGACCTCAAAAATCTGGTGAGAGAGCTGTCTCAGGGGAAAGAGATGGCTAAGCAGCTTCAAAATCATCTCAATTTGCACTCATCTTCTTCACGTGAGAGTCGCGAATTTTTGCTGCACAGAATTATGTATTCCTACGATCAGGCGCTCTCCATGCTCACGCACAACGACCCTGCTGCTGCTGCTGCTAGTCAAGCACCGCTGCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798625.1
MSSPPFSGKGMENFPSDSDLKNLVRELSQGKEMAKQLQNHLNLHSSSSRESREFLLHRIMYSYDQALSMLTHNDPAAAAASQAPLPPPESPRPVAGSPQSDDSDQDFTDQTSRKRKASDRWSQKVKVGPEVGVEGQLDDGYGWRKYGQKEILGAKHPRGYYRCTYRHAHGCLATKQVQRSDEDPTIFEITYRRKHTCNRATNNPPVPDPRGQDPNPLTQNPQSEPPFNIQTTLNPPFNFSSSSPINPQNDNIFSDRNNAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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