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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003782`

染色体: Chr03 坐标: 56938455-56941564 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003782`
名称	SmilChr03G003782
描述	rust resistance kinase Lr10-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56938455 - 56941564 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014636`
GeneID	`131014636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014636`
原始查询	`LOC131014636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rust resistance kinase Lr10-like
产物	rust resistance kinase Lr10-like
Arabidopsis	`AT5G38280` (PR5K) PR5-like receptor kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833810] identity=51.2; qcov=0.447; evalue=2.15e-102; confidence=low
Rice	`Os01g0115700` - identity=37.9; qcov=0.932; evalue=1.46e-125; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798657.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798657.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798657.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798657.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798657.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56938834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:56938959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A8,B40,C27
`Chr3:56939003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr3:56939014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:56939112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:56939212`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C44
`Chr3:56939212`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C44
`Chr3:56939220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A8,B40,C27
`Chr3:56939236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:56939238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:56939249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A8,B40,C27
`Chr3:56939308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798657.1

674 aa

337

674

GUB_WAK_bind

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF13947 GUB_WAK_bind 33-96 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 356-624 aa PF00069 Pkinase 357-622 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798657.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	33	96	1.6e-14	54.7	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057798657.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	356	624	1.2e-44	153.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798657.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	357	622	1.9e-47	162.6	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942674.1
ATATCTCATCCAAAAAAGAGTATAGACTGCAAAATCAGTTGTCTGAACCATGATCACTCAAAACCTCATCTTCCTCACCACTTCATCTCTCTTCATTCTCTCACTACTCCATAATTTGTTTCAAACTTGTAATGCCAACTCTTATTGCAGTCCTTCTGCGTGTGGCATCTTTCCCAATATCAGCTCCCCTTTCCACCTCAAGGGCGATCCCAGCAACTGTGGTGATCGCAGAGTTGAGTTAGCCTGCGAAAACAATGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014636
ATGATCACTCAAAACCTCATCTTCCTCACCACTTCATCTCTCTTCATTCTCTCACTACTCCATAATTTGTTTCAAACTTGTAATGCCAACTCTTATTGCAGTCCTTCTGCGTGTGGCATCTTTCCCAATATCAGCTCCCCTTTCCACCTCAAGGGCGATCCCAGCAACTGTGGTGATCGCAGAGTTGAGTTAGCCTGCGAAAACAATGTGACCTCCATCTATCTCAACTCTCACAAATACTATGTCAAAGCCATCAACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798657.1
MITQNLIFLTTSSLFILSLLHNLFQTCNANSYCSPSACGIFPNISSPFHLKGDPSNCGDRRVELACENNVTSIYLNSHKYYVKAINYSNAAIRLVDASINNDDICSFPTVSLYQRPLPCSIPRYSTSPINFVNCPNPLANSSLFTDITNHCASNSSLPTPRYAYIKVGHMNASELPHRCAVHLIVLTSWHFKDLKNVVSLSEIHQSLLYGFELVVCPSWFCAASTSIIVVFFYSIIPILLVIIGLLCAAISPPVFTIFGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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