当前解析结果
SmilChr03G003798| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003798 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003798 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003798 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 57055180 - 57058229 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014649 |
|---|---|
| GeneID | 131014649 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014649 |
| 原始查询 | LOC131014649 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014649 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798675.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057798675.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057798677.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798675.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798675.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:57057076 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B114,B30,C34 |
Chr3:57057076 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B114,B30,C34 |
Chr3:57057078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B31,B54,D7 |
Chr3:57057087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr3:57057093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr3:57057098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B67,C60,C66,C67,C84 |
Chr3:57057119 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B129,C18,C7,D8 |
Chr3:57057126 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,A3,C3 |
Chr3:57057179 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 22 | A14,A16,A18,A9,B101,B103,B120,B2,B24,B27,B4,B47,B48,B50,B66,B67,B75,B86,B9,B94,C12,C86 |
Chr3:57057187 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,A3 |
Chr3:57057198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C42 |
Chr3:57057231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B16,B26,B30,C23,C34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。