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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003807`

染色体: Chr03 坐标: 57133816-57142213 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003807`
名称	SmilChr03G003807
描述	rust resistance kinase Lr10-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57133816 - 57142213 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014663`
GeneID	`131014663`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014663`
原始查询	`LOC131014663`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rust resistance kinase Lr10-like
产物	rust resistance kinase Lr10-like
Arabidopsis	`AT4G18250` (AT4G18250) receptor Serine/Threonine kinase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827551] identity=45.2; qcov=1.03; evalue=9.25e-98; confidence=high
Rice	`Os05g0550700` - identity=52.3; qcov=0.91; evalue=1.18e-108; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014663

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798686.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798686.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798686.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798686.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57134046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57134074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B138
`Chr3:57134080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B75,D10
`Chr3:57134092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr3:57134097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B74,B75,C54,C60
`Chr3:57134141`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B122,B2,B79,C5
`Chr3:57134141`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B122,B2,B79,C5
`Chr3:57134145`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B122,B2,B79,C5
`Chr3:57134145`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B122,B2,B79,C5
`Chr3:57134154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B19,B76,D4
`Chr3:57134159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr3:57134186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798686.1

332 aa

166

332

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-281 aa PF00069 Pkinase 6-279 aa

XP_057798687.1

332 aa

166

332

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-281 aa PF00069 Pkinase 6-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798686.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	5	281	1.1e-46	159.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798686.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	6	279	6.4e-47	160.9	Protein kinase domain
`XP_057798687.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	5	281	1.1e-46	159.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798687.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	6	279	6.4e-47	160.9	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942704.1
AAAAAGAGTAGAATATGTATGCTGCTTCTGGAAAATCAATTGTTATCTAATTTTGTTAATCATAATTCCATCACATAGCTAACTTTAAACCATGATCACTAAAAACCTCATCTTCCTCACCAATTCATCTCTCTTGATTCTCTCACTACTTAATAATTTGTTTCAAACTTGTAATGCCAACTATAGTTGCAGTCCTTCTGCGTGTGGCATATTTCCCAATATCAGCTCCCCTTTCCGCCTCAAGGGCGATCCCAGCAACT...

XM_057942703.1
AAAAAGAGTAGAATATGTATGCTGCTTCTGGAAAATCAATTGTTATCTAATTTTGTTAATCATAATTCCATCACATAGCTAACTTTAAACCATGATCACTAAAAACCTCATCTTCCTCACCAATTCATCTCTCTTGATTCTCTCACTACTTAATAATTTGTTTCAAACTTGTAATGCCAACTATAGTTGCAGTCCTTCTGCGTGTGGCATATTTCCCAATATCAGCTCCCCTTTCCGCCTCAAGGGCGATCCCAGCAACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014663
ATGACGAGAGGTTTTCAAGAAAAACTAGGCCAAGGAGGATTCGGTTCTGTTTACAAAGGAAAGCTCCGAAGTGGCCATGATGTAGCAGTTAAACTACTGGGAAAGGCTACAACGAATGGACAAGACTTTATCAATGAAATTGGTACCATTGGGAGGATCCATCATGTGAATGTTGTCAAGCTTGTTGGATATTGTGCTGAAAGGTCCAAACACGCCCTCATATTCGATTTCATGCCCAATGGCTCTCTTGAAAAGTACAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798686.1
MTRGFQEKLGQGGFGSVYKGKLRSGHDVAVKLLGKATTNGQDFINEIGTIGRIHHVNVVKLVGYCAERSKHALIFDFMPNGSLEKYIFNREKASSLDWDMKFKIAVEVARGIEYLHCGCDIQILHFDIKPHNILLDDKFVPKISDFGLAKLCSIEKDTVTMTAARGTIGYVAPELINRSIGGVSYKADVYSFGMLLMEMVGLNKELRGNNDDSSKYFPDWIYDHFNQGRDIEIEKAEENNGNDDENESRKSLVHKMTIVA...

XP_057798687.1
MTRGFQEKLGQGGFGSVYKGKLRSGHDVAVKLLGKATTNGQDFINEIGTIGRIHHVNVVKLVGYCAERSKHALIFDFMPNGSLEKYIFNREKASSLDWDMKFKIAVEVARGIEYLHCGCDIQILHFDIKPHNILLDDKFVPKISDFGLAKLCSIEKDTVTMTAARGTIGYVAPELINRSIGGVSYKADVYSFGMLLMEMVGLNKELRGNNDDSSKYFPDWIYDHFNQGRDIEIEKAEENNGNDDENESRKSLVHKMTIVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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