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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003815`

染色体: Chr03 坐标: 57178742-57181719 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003815`
名称	SmilChr03G003815
描述	rust resistance kinase Lr10-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57178742 - 57181719 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014674`
GeneID	`131014674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014674`
原始查询	`LOC131014674`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rust resistance kinase Lr10-like
产物	rust resistance kinase Lr10-like
Arabidopsis	`AT5G38280` (PR5K) PR5-like receptor kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833810] identity=51.1; qcov=0.524; evalue=1.3e-103; confidence=medium
Rice	`Os01g0117300` (OsRLCK17) - identity=55; qcov=0.546; evalue=4.86e-124; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798697.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798697.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798697.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798697.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57178955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C8,D10
`Chr3:57179100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:57179158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:57179222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C48
`Chr3:57179223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:57179252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,C8,D10,D11
`Chr3:57179300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A2,B110,B112,B117,B122,B16,B18,B2,B20,B32,B56,B6,B79,B81,B91,B93,B96,C10,C13,C21,C25,C45,C5,C59,C64,C66,C67,C70,C75,C76,D3,D5,D8
`Chr3:57179318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:57179328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:57179362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr3:57179376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:57179382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798697.1

641 aa

320

641

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 306-575 aa PF00069 Pkinase 307-573 aa

XP_057798698.1

586 aa

293

586

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 251-520 aa PF00069 Pkinase 252-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798697.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	306	575	8e-46	157.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798697.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	307	573	8.7e-46	157.2	Protein kinase domain
`XP_057798698.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	251	520	6.3e-46	157.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798698.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	252	518	7.1e-46	157.4	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942715.1
AAGTCGTGTTTGCTGGGCCTGCATGATTGATTTATATATATATATATGACGTCGTTGTCCATATGTGATGACGTATTCAAACAATGAAACATAGTCATGATTATATTATTTATTTGGATTTATTATAATATCCAACTATGATTTGTAGCTTGATATTTTGGATGTTATTATTGTGTTAGCGTAAGTAAATAATTATATGTTGTGCTGAAGCAATTATGATCCCGTTCAATTGTCGACTGTAGAAAACAATTTCTGCTCAT...

XM_057942714.1
AAGTCGTGTTTGCTGGGCCTGCATGATTGATTTATATATATATATATGACGTCGTTGTCCATATGTGATGACGTATTCAAACAATGAAACATAGTCATGATTATATTATTTATTTGGATTTATTATAATATCCAACTATGATTTGTAGCTTGATATTTTGGATGTTATTATTGTGTTAGCGTAAGTAAATAATTATATGTTGTGCTGAAGCAATTATGATCCCGTTCAATTGTCGACTGTAGAAAACAATTTCTGCTCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014674
ATGAACCACACCATCAGGGTGACTGATGCTTCCATCAACAACCACACCTGCTCTTTCCCCATCCATTCTTTAGACTACTACCCTCATCCATACTCTCCTGCTGAAACACGCCATGTTCATTTCATAAGCTGCCCAACTCCCTTGAACAATTCTTCCATCTTTACCCACATAACCGCTCATTGCGCTTCAAATTCATCCCACCCCGCCTTTGCTTATGTCAAGGCCGGCAGAATGACCCCCTCAGACGTACCACCTGCGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798697.1
MNHTIRVTDASINNHTCSFPIHSLDYYPHPYSPAETRHVHFISCPTPLNNSSIFTHITAHCASNSSHPAFAYVKAGRMTPSDVPPACRVDLVVMTSWAFNDSNNASLSEIHESLLYGFEINFCGDCKELTSGIFGLLGKDCIDLSCVYECYLLLIILIIYIFRVSLDSALHLRCTPQFLFHYPLIKHRIRMQLIVILFEKVAGLILAGIAFPVTIFLGFALSLYVLFRLILSKHTGAHILIPSITGLIITAPKVIICPLV...

XP_057798698.1
MNHTIRVTDASINNHTCSFPIHSLDYYPHPYSPAETRHVHFISCPTPLNNSSIFTHITAHCASNSSHPAFAYVKAGRMTPSDVPPACRVDLVVMTSWAFNDSNNASLSEIHESLLYGFEINFCGDCKELTSGIFGLLGYLSILLCILGLILAGIAFPVTIFLGFALSLYVLFRLILSKHTGAHILIPSITGLIITAPKVIICPLVVWFLIYKCRRRHLSTYEAIESFLQSDNKLTPIRYSYSQIKKMTQNFQDKLGQGGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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