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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002236`

染色体: Chr01 坐标: 38899798-38902795 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002236`
名称	SmilChr01G002236
描述	probable eukaryotic translation initiation factor 5-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38899798 - 38902795 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014678`
GeneID	`131014678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014678`
原始查询	`LOC131014678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable eukaryotic translation initiation factor 5-1
产物	probable eukaryotic translation initiation factor 5-1
Arabidopsis	`AT1G36730` (AT1G36730) Translation initiation factor IF2/IF5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840582] identity=63.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0698674` - identity=64.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0001731 (formation of translation preinitiation complex); GO:0001732 (formation of cytoplasmic translation initiation complex); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005092 (GDP-dissociation inhibitor activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006413 (translational initiation); GO:0071074 (eukaryotic initiation factor eIF2 binding)
KEGG	-
Pfam	PF01873 (eIF-5_eIF-2B); PF02020 (W2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798712.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798712.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798712.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057798712.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38901167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:38901584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B95,C34,C70
`Chr1:38901650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:38901716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:38901815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:38902178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B50,D11
`Chr1:38902206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C13
`Chr1:38902208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C49
`Chr1:38902274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:38902325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B59,B95,C34,C70
`Chr1:38902346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C14,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798712.1

445 aa

222

445

eIF-5_eIF-2B

PF01873 eIF-5_eIF-2B 11-127 aa PF02020 W2 366-445 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798712.1`	Pfam	`PF01873`	eIF-5_eIF-2B	Family	11	127	1e-34	119.6	Domain found in IF2B/IF5
`XP_057798712.1`	Pfam	`PF02020`	W2	Repeat	366	445	5.5e-21	75.1	eIF4-gamma/eIF5/eIF2-epsilon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942729.1
ACATTTATTTGAGGAGAAAGGCGGTGTTTGGCTATATATTTAGTTTAGCCCTAAATCCTAATCCCTTGACAACTAGGGTTTCCTACTTCCTCTATATATACGTCATCTCTTTCCGTTCCTCCTCAACCACTCGCTCTCCTACGGAAATTCCTTACCTTTCTTCCATTCTCTCTCCTGCTCGCTTCTCTCTCTATTTTCCTCTCTTCTCAGCATAACTAAGGGCTTTGGCTTGTGGACTTGCAGTAATTGCAGTCAGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014678
ATGGCTTTGCAAAACATTGGTGCTGGGAACAAGGATGATGCCTTCTATAGGTATAAGATGCCCAGGATGATCACAAAAATTGAGGGCCGTGGTAATGGCATCAAGACCAACATAGTCAATATGGTTGACATTGCAAAGGCTTTGGGTAGGCCGGCCTCTTACACAACCAAGTACTTTGGCTGTGAGCTGGGAGCTCAATCCAAGTTTGATGAGAAGACTGGAACTTCCCATGTCAATGGATCTCATGATACTTCAAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798712.1
MALQNIGAGNKDDAFYRYKMPRMITKIEGRGNGIKTNIVNMVDIAKALGRPASYTTKYFGCELGAQSKFDEKTGTSHVNGSHDTSKLAGLLENFIKKFVQCYGCGNPETEIIITKSQMINLKCAACGFISEVDMRDKLTTFIIKNPPEAKKGGKDKKLRRAEKERLKEGEAADEELKKQKKEAAKKKASSGSSKDAVSKSSKKKSHNSDEDHSPAGSLKDDREAAEDSDDDVEWQTDTSSVAAQQTIQEQLNAVTASMVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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