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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003874`

染色体: Chr03 坐标: 57858403-57870769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003874`
名称	SmilChr03G003874
描述	MAG2-interacting protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57858403 - 57870769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014682`
GeneID	`131014682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014682`
原始查询	`LOC131014682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MAG2-interacting protein 2
产物	MAG2-interacting protein 2
Arabidopsis	`AT5G24350` (AT5G24350) neuroblastoma-amplified sequence protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832505] identity=49.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0233600` - identity=37; qcov=0.185; evalue=1.54e-78; confidence=weak
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0070939 (Dsl1/NZR complex)
KEGG	-
Pfam	PF08314 (Sec39); PF24520 (ARM_KNTC1_1st); PF26751 (All-alpha_MIP2); PF26752 (MIP2_C); PF30506 (Beta-prop_MIP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798716.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057798716.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798716.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798716.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57859251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B86
`Chr3:57859251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr3:57860257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B66,C30,D1
`Chr3:57860332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B66,C30,D1
`Chr3:57861286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:57861866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C39,C69
`Chr3:57861874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:57861912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B95,C7,C71,D6
`Chr3:57861915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:57862778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B51,B68
`Chr3:57862975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:57863128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798716.1

2387 aa

1194

2387

Beta-prop_MIP2

ARM_KNTC1_1st

Sec39

All-alpha_MIP2

MIP2_C

PF30506 Beta-prop_MIP2 10-387 aa PF24520 ARM_KNTC1_1st 437-639 aa PF08314 Sec39 576-883 aa PF08314 Sec39 899-1108 aa PF26751 All-alpha_MIP2 1680-2013 aa PF26752 MIP2_C 2033-2383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798716.1`	Pfam	`PF30506`	Beta-prop_MIP2	Repeat	10	387	8.1e-159	529.3	MIP2, beta-propeller domain
`XP_057798716.1`	Pfam	`PF24520`	ARM_KNTC1_1st	Repeat	437	639	4.4e-10	40.5	KNTC1 first ARM-repeats domain
`XP_057798716.1`	Pfam	`PF08314`	Sec39	Repeat	576	883	2.3e-26	93.3	Secretory pathway protein Sec39
`XP_057798716.1`	Pfam	`PF08314`	Sec39	Repeat	899	1108	2.3e-26	93.3	Secretory pathway protein Sec39
`XP_057798716.1`	Pfam	`PF26751`	All-alpha_MIP2	Repeat	1680	2013	1.6e-128	429.0	MIP2 alpha-solenoid domain
`XP_057798716.1`	Pfam	`PF26752`	MIP2_C	Repeat	2033	2383	2.5e-158	527.1	MIP2 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942733.1
GACTAATACCATAAAACGCTTTTATCACTGAAACGCGATTTAAATTGGGTTCCCTGACACGGCGTCCGGCGAAGGCAGTAATCAAAGGATCAGTCTCCTTCTCCCCTCCGGCCCTCTGCAATTCTGCGGTTTAGATCTCGGCGGAAAACTCGCAGAAATTGCAGTTCTTGCTATCAGTTTCATGTACGTATTCAATTATTTGTGCGTATAGATGGGGGAGACCGTACAGAAGGCACTGTTCGAGACGCGTCGTCACGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014682
ATGGGGGAGACCGTACAGAAGGCACTGTTCGAGACGCGTCGTCACGCTTCCAGACCTTACTTTTCCAATTATCCTCCGCAGCAACAGCTGAAAGATGGCGGCGGGGGTGGCTTACTTTCTTATGTTCCATTTCGAGGAGGGATTACTCAACTCAAAGAGAAATGGAGTGTGTACAGACAACCTAGAAGATTAAGAAGATTAGTGTCCTTGTTTGTATCTGCAAGAGGTGATTATGTTGCTGTAGCTTATGGAAATCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798716.1
MGETVQKALFETRRHASRPYFSNYPPQQQLKDGGGGGLLSYVPFRGGITQLKEKWSVYRQPRRLRRLVSLFVSARGDYVAVAYGNQIAILRKENDYQEPVGNFTCESAGVFTCGTWSETHELLGVVDDTGTIYVVKPYGEEMTRITKRHLNLSSPIVGLILQDDASEKKSYLCSFTVFAADGSFHDIEISKDPSASISSAKSLNNPSMLRQFPSEICCWDYHPELSLFAIVSSASDSKSTLTGSTGSYTVSIWRRKQSLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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