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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003860`

染色体: Chr03 坐标: 57682363-57687272 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003860`
名称	SmilChr03G003860
描述	importin subunit beta-1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57682363 - 57687272 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014683`
GeneID	`131014683`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014683`
原始查询	`LOC131014683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	importin subunit beta-1
产物	importin subunit beta-1
Arabidopsis	`AT5G53480` (AT5G53480) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835429] identity=83.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0568800` - identity=84; qcov=0.806; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0008139 (nuclear localization sequence binding); GO:0031267 (small GTPase binding); GO:0061608 (nuclear import signal receptor activity)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03810 (IBN_N); PF13513 (HEAT_EZ); PF25574 (TPR_IMB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014683

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798717.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798717.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798717.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057798717.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057798717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57683486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:57683488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:57683489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:57683709`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A20,B118,B65,B87,C32,C54,C68,C69,C75,C83
`Chr3:57683831`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	230	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:57683930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:57684028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B60
`Chr3:57684379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C62
`Chr3:57684386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:57684413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C54
`Chr3:57684479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C85
`Chr3:57684482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798717.1

871 aa

436

871

IBN_N

HEAT_EZ

TPR_IMB1

PF03810 IBN_N 23-102 aa PF13513 HEAT_EZ 381-437 aa PF25574 TPR_IMB1 459-827 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798717.1`	Pfam	`PF03810`	IBN_N	Repeat	23	102	2.5e-12	47.3	Importin-beta N-terminal domain
`XP_057798717.1`	Pfam	`PF13513`	HEAT_EZ	Repeat	381	437	2.4e-22	79.6	HEAT-like repeat
`XP_057798717.1`	Pfam	`PF25574`	TPR_IMB1	Repeat	459	827	8.7e-116	387.5	Importin subunit beta-1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942734.1
TAGTTCACATAATTCAAGTGTTCAGCTTTACGGATTTTCTCTCTCTAAAACGCACACGCAGAGACTCCCCACTTTCTCTCTCTAAAAACTCCCTGTTTAGGGTTTTCCGGGGCGCCGCTTTTGAATTAATAAGATCCGAAAGTGAACTCTTCATTCGCTCTCTCTCCCCTCCTCGTCTTTTTCCCCCCAGGGAGGATATGGCTATGGAAGTCACTCAGATCCTTCTAAGTGCGCAGTCCGTTGATTCAACAGTTAGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014683
ATGGCTATGGAAGTCACTCAGATCCTTCTAAGTGCGCAGTCCGTTGATTCAACAGTTAGGAAGCATGCTGAAGAGAGTTTGAAGCAATTTCAAGAGCAAAACCTTCCGGCTTTCTTGTTGTCTTTATCTGTAGAGCTTGCTAGTGAGGAGAAGCCCGTTGACAGCCGTAAACTTGCTGGTTTGGTTTTAAAAAATGCTTTGGATGCGAAGGAGCAGCATAGAAAGTATGAGCTCGTGCAAAGGTGGCTGTCATTAGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798717.1
MAMEVTQILLSAQSVDSTVRKHAEESLKQFQEQNLPAFLLSLSVELASEEKPVDSRKLAGLVLKNALDAKEQHRKYELVQRWLSLDVSVKSQIKACLLQTLSSTAVDARSTASQVIAKVAGIELPQKQWPELVGSLLSNVHQVPPHVKQATIETLGYLCEEVAPEVIDQDQVNKILTAVVQGMNANEGNIEVRLASTRALYNALGFAQANFSNDMERDYIMRVVCEATLSPEVKIRQAAYECLVSIGSTYYEKLAPYIQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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