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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003882`

染色体: Chr03 坐标: 57903333-57906932 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003882`
名称	SmilChr03G003882
描述	2-hydroxyacyl-CoA lyase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57903333 - 57906932 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014698`
GeneID	`131014698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014698`
原始查询	`LOC131014698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-hydroxyacyl-CoA lyase
产物	2-hydroxyacyl-CoA lyase
Arabidopsis	`AT5G17380` (AT5G17380) Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831604] identity=76.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0505400` - identity=72.5; qcov=0.802; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0001561 (fatty acid alpha-oxidation); GO:0003824 (catalytic activity); GO:0005777 (peroxisome); GO:0030976 (thiamine pyrophosphate binding)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00205 (TPP_enzyme_M); PF02775 (TPP_enzyme_C); PF02776 (TPP_enzyme_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798735.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798735.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057798735.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798735.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57903650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:57903674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B72
`Chr3:57903705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:57903746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr3:57903815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:57903914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C61
`Chr3:57904035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:57904226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:57904281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:57904285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57904313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57904400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798735.1

575 aa

288

575

TPP_enzyme_N

TPP_enzyme_M

TPP_enzyme_C

PF02776 TPP_enzyme_N 15-128 aa PF00205 TPP_enzyme_M 209-334 aa PF02775 TPP_enzyme_C 410-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798735.1`	Pfam	`PF02776`	TPP_enzyme_N	Domain	15	128	6.8e-29	100.8	Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain
`XP_057798735.1`	Pfam	`PF00205`	TPP_enzyme_M	Domain	209	334	4.3e-32	111.4	Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain
`XP_057798735.1`	Pfam	`PF02775`	TPP_enzyme_C	Domain	410	558	2.5e-25	89.7	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942752.1
TATGATAGTGGAATGTAATTTCCATTTTGGTACCTACCTCCATCACATTTTGAAGTATAGTATCCAGGGCAGGCGTTTTCTTCTACACCTTCAAGCTCCAAAACTATAAATTTCCCAAAATCAAACTACTCTACTTTACCCAAATTCTCACTCATCAGTCACCACTCTCCAATGGCGGACGCCCACAGCAACAAGCCGCCACCAACGATCGACGGAAACGCCCTCGTCTCCATGTGCCTGTCACGCGCCGGCATCGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014698
ATGGCGGACGCCCACAGCAACAAGCCGCCACCAACGATCGACGGAAACGCCCTCGTCTCCATGTGCCTGTCACGCGCCGGCATCGACAGGATGTTCGGAGTCGTCGGAATCCCCGTCACCTCACTCGCCAACCGCGCCGTAGCCCTCGGCGTCCGCTTCATCGCCTTCCACAACGAGCAATCCGCGGGCTACGCCGCCTCCGCCTACGGCTACCTCACCGGCCGCCCCGGCATCCTCCTCACCGTCTCCGGCCCCGGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798735.1
MADAHSNKPPPTIDGNALVSMCLSRAGIDRMFGVVGIPVTSLANRAVALGVRFIAFHNEQSAGYAASAYGYLTGRPGILLTVSGPGCVHGLAGLSNAAANAWPMVLISGSSDQSLAGRGDFQELDQIAAVKPFAKFSAKATDITEIPKSVFSVVDWAVAGRPGGTYLDLPTDVLHQTVDESEAERLITEALKSRNKALIEKPRIDSSKIKKAVELLRTAQRPLIVFGKGAAYAKSENELTKLVESTGIPFLPTPMGKGLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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