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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002240`

染色体: Chr01 坐标: 38949313-38953240 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002240`
名称	SmilChr01G002240
描述	uncharacterized SmilChr01G002240
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38949313 - 38953240 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014727`
GeneID	`131014727`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014727`
原始查询	`LOC131014727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0612000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0612000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G36390` (AT1G36390) Co-chaperone GrpE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840545] identity=46.8; qcov=0.743; evalue=1.39e-73; confidence=high
Rice	`Os02g0612000` - identity=56.6; qcov=0.621; evalue=9.39e-78; confidence=high
GO	GO:0000774 (adenyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0006457 (protein folding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0042803 (protein homodimerization activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding)
KEGG	-
Pfam	PF01025 (GrpE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014727

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798793.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057798793.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798793.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798793.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38949599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:38951771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C14,C74
`Chr1:38951806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:38951830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A24,B33,B69,C19
`Chr1:38951882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B38,B39,C23
`Chr1:38951898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:38952142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:38952165`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A4,A9,B103,B11,B111,B115,B118,B125,B128,B133,B134,B135,B15,B26,B37,B5,B52,B57,B58,B59,B60,B61,B64,B72,B80,B83,B87,B98,C21,C27,C31,C36,C37,C39,C40,C41,C43,C51,C53,C55,C59,C60,C7,C73,C79,C80,C81,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798793.1

319 aa

160

319

GrpE

PF01025 GrpE 144-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798793.1`	Pfam	`PF01025`	GrpE	Family	144	297	9.6e-41	139.9	GrpE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942810.1
TGAAGACATTTTTGTAAATCTCTCTGGTCTCTTCCACAACAAACCAACCACCAATTCTTTTCACCCATTATTTTGCTTACAAATCCTTTCCATCTCTTTCTTGCAGAGTGTAGCGAGTGCGGAAATGGCGGCTTCGGCCTCTCTGTCTAACGCTTTCTCTCTCTACAGTCCCCGAAGCGTCTCCTTGAAACCCTCCCACCATTTGTCTCTTCAACCCACGAGCATTCAACAATTTGTTGTTCATGGAAAACCCATTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014727
ATGGCGGCTTCGGCCTCTCTGTCTAACGCTTTCTCTCTCTACAGTCCCCGAAGCGTCTCCTTGAAACCCTCCCACCATTTGTCTCTTCAACCCACGAGCATTCAACAATTTGTTGTTCATGGAAAACCCATTTCGAGAGCAGCTGTTTCTTCCTCTCCCGTTCTGAACGCGTATTGGCAATTTGGGATTAATTCGAGATTTGGTAATAATTGGTATAGGAATGACAGGCGTTCTTCTCTCAGGCCTTCAGATTCAGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798793.1
MAASASLSNAFSLYSPRSVSLKPSHHLSLQPTSIQQFVVHGKPISRAAVSSSPVLNAYWQFGINSRFGNNWYRNDRRSSLRPSDSAQHENQTYNEDKSGSDRAASKKSQPDMKSLMQLYKEAIAYGDARAMYEIENILFTIDKEKIELADRVSALSEEVSSGKEKFLRLQADFDNYRKRSEKERATVRSDAQGEVIESLLPMVDSFERAKQQLKIETEMEKKIDTSYQGIYKQFIEIMRSLRVAAVPTVGKPFDPSMHEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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