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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003852`

染色体: Chr03 坐标: 57637603-57639621 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003852`
名称	SmilChr03G003852
描述	uncharacterized SmilChr03G003852
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57637603 - 57639621 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014732`
GeneID	`131014732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014732`
原始查询	`LOC131014732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835384]; symbol=AT5G53045; hit=AT5G53045; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835384]; symbol=AT5G53045; hit=AT5G53045; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G53045` (AT5G53045) transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835384] identity=71.6; qcov=0.88; evalue=4.6e-42; confidence=medium
Rice	`Os02g0305800` - identity=72.5; qcov=0.8; evalue=7.36e-39; confidence=medium
GO	GO:0000408 (EKC/KEOPS complex); GO:0070525 (tRNA threonylcarbamoyladenosine metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF09341 (Pcc1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798797.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798797.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798797.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057798797.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798797.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57637769`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B119
`Chr3:57637769`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798797.1

100 aa

100

Pcc1

PF09341 Pcc1 19-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798797.1`	Pfam	`PF09341`	Pcc1	Family	19	92	8.6e-23	81.3	Transcription factor Pcc1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942814.1
AATATTTTTTTAGAATATGCTTCGATTCTTATGACATACTAAATATGAATAATTGTACACAACCAAATTTGGGCCATAACTATTACGAAATCAACCATGTGTCAGTTTAGGAACTCAATTTTCAGAAGTAAAAGGAGAAAGAAAACCGTAAATCCAAATCATAGAAAAACATAAAAGGGTCGACCCGGTTTGTGTCGCCCGACCCAACCGGATAGTTGTTGCCCTAAACCGTTTCTGCGTCTTCTTTCGACGCGAAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014732
ATGGAAAACTTAGCTGCTGACCTCACTACCGGAGCTCCAAACAAATGGGATTTCAGATGCAACTTGGAAGTAGATTATGCGTCTGAGGAAGTTGCTCGCATGGTTTATGCTGCTCTAGCCGTTGATAAGGAGTTACAACCAGATAAGGTGAAAAGGCATATGTCAGTATCCAACGGGAAACTTTCTGTGAATTTTGAGGCTGTCGAAGCAAGATTCCTTCGTGCATCATACAGTGCTTTTGTCGATGTTCTTACACTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798797.1
MENLAADLTTGAPNKWDFRCNLEVDYASEEVARMVYAALAVDKELQPDKVKRHMSVSNGKLSVNFEAVEARFLRASYSAFVDVLTLATKTIEEFGQGLIQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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