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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003883`

染色体: Chr03 坐标: 57913004-57916679 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003883`
名称	SmilChr03G003883
描述	metal-nicotianamine transporter YSL3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57913004 - 57916679 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014741`
GeneID	`131014741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014741`
原始查询	`LOC131014741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal-nicotianamine transporter YSL3-like
产物	metal-nicotianamine transporter YSL3-like
Arabidopsis	`AT5G53550` (YSL3) YELLOW STRIPE like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835437] identity=72; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0542200` (OsYSL9) - identity=68.1; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010039 (response to iron ion); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity); GO:0048316 (seed development); GO:0051980 (iron-nicotianamine transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798801.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057798801.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057798801.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798801.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57913756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:57913799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:57913829`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	76	A14,A19,A20,A24,A25,A5,B10,B100,B102,B107,B108,B11,B12,B122,B129,B13,B139,B140,B15,B19,B25,B3,B32,B35,B41,B46,B52,B54,B6,B65,B7,B71,B73,B75,B76,B77,B8,B82,B83,B86,B88,B9,B92,B95,B98,C10,C11,C13,C16,C18,C2,C20,C26,C31,C37,C38,C39,C42,C45,C50,C54,C58,C59,C6,C61,C64,C67,C74,C77,C79,C80,C81,C9,D1,D3,D8
`Chr3:57913837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C38,C9
`Chr3:57913851`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	95	A14,A18,A19,A2,A20,A24,A25,A5,B10,B100,B102,B107,B108,B11,B118,B12,B121,B122,B124,B128,B129,B13,B133,B136,B139,B140,B15,B19,B25,B26,B29,B3,B32,B35,B4,B41,B46,B52,B54,B6,B65,B66,B7,B73,B74,B75,B77,B8,B82,B83,B86,B88,B9,B90,B92,B95,B98,C10,C11,C13,C16,C18,C2,C20,C25,C26,C27,C37,C38,C39,C40,C42,C45,C46,C5,C50,C51,C54,C55,C58,C59,C6,C61,C67,C74,C77,C79,C80,C81,C85,C9,D1,D3,D5,D8
`Chr3:57913875`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	104	A14,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A5,B10,B100,B102,B107,B108,B11,B112,B114,B118,B12,B121,B122,B124,B128,B129,B13,B133,B136,B139,B140,B15,B19,B25,B26,B29,B3,B32,B35,B41,B45,B48,B52,B54,B57,B6,B65,B66,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B82,B83,B85,B86,B88,B9,B90,B92,B95,B98,C10,C11,C13,C16,C18,C2,C20,C26,C27,C3,C37,C38,C39,C40,C42,C43,C45,C5,C50,C51,C54,C55,C58,C59,C6,C64,C67,C74,C77,C79,C80,C81,C85,C9,D1,D5,D8
`Chr3:57913927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C80
`Chr3:57913946`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A20,A21,B11,B122,B136,B76,C42,C58,C9
`Chr3:57913949`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A20,A21,B11,B122,B136,B76,C42,C58,C9
`Chr3:57914020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:57914482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:57914536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B36,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798801.1

667 aa

334

667

OPT

PF03169 OPT 36-648 aa

XP_057798802.1

667 aa

334

667

OPT

PF03169 OPT 36-648 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798801.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	36	648	1.2e-159	533.6	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057798802.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	36	648	1.2e-159	533.6	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942818.1
TTTGTAGTACACACAAAAACGTTTAATGAATACTAATGCCTGAATTTGTACTACTCCGGTTGTACTAGTACGCTATTTCAACTGTTTTATTGATAGCTTTAAATTCAGGTTGTTTTTTGCCGATCACAGATCTTACTGCATTGGGGTAAAAACCTCGAATTTTGGGTTTTGCATAATCTCATTGAAATTTCAAATTCCTAAAGTTGGTGGGAAGAAAAATCACGTGGGAGGTTGTGTGTGGAATTCATGTTTTTGTGGGT...

XM_057942819.1
TGTACTACTCCGGTTGTACTAGTACGCTATTTCAACTGTTTTATTGATAGCTTTAAATTCAGGTTGTTTTTTGCCGATCACAGATCTTACTGCATTGGGGTAAAAACCTCGAATTTTGGGTTTTGCATAATCTCATTGAAATTTCAAATTCCTAAAGTTGGTGGGAAGAAAAATCACGTGGGAGGTTGTGTGTGGAATTCATGTTTTTGTGGGTTTTGCAGTAAATCCCATCTTCATCTTGTTCAGTGGAAGAAATCACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014741
ATGGAGAGTCATGAAAGAGGGGAAAACACAGAAATTGAGAGTCAGAATTTGGGGGAAAATAGTGAGCTACCAGATGATATGAAGAGGATTCCTCCATGGGAAAAACAGATAACTATTCGAGGAATGATTGCTGGTTTATTTATTGGAATGATTTACAGTGTTGTGTTGATGAAGCTCAATCTCTCAACTGGGCTAGTGCCAAACCTCAATGTATCAGCTGCCCTGCTTGCATTTGTGTTCATTCGAACATGGACTAAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798801.1
MESHERGENTEIESQNLGENSELPDDMKRIPPWEKQITIRGMIAGLFIGMIYSVVLMKLNLSTGLVPNLNVSAALLAFVFIRTWTKLLEKSNVMTTPFTRQENTVIQTCAVACYGLSYGGGFASFLLALNKKTYEQAGVDTEGNSPTSHKEPGFDWMTGFLFVVSFVGLLALVPLRKIMIIDYKLPYPSGTATAVLINGFHTSKGDKMAKKQVRGFMKFFSFSFLWSFFQWFYSGGDQCGFSNFPTFGLKAWKQTFFFDF...

XP_057798802.1
MESHERGENTEIESQNLGENSELPDDMKRIPPWEKQITIRGMIAGLFIGMIYSVVLMKLNLSTGLVPNLNVSAALLAFVFIRTWTKLLEKSNVMTTPFTRQENTVIQTCAVACYGLSYGGGFASFLLALNKKTYEQAGVDTEGNSPTSHKEPGFDWMTGFLFVVSFVGLLALVPLRKIMIIDYKLPYPSGTATAVLINGFHTSKGDKMAKKQVRGFMKFFSFSFLWSFFQWFYSGGDQCGFSNFPTFGLKAWKQTFFFDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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