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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002242`

染色体: Chr01 坐标: 38961360-38965002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002242`
名称	SmilChr01G002242
描述	uncharacterized SmilChr01G002242
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38961360 - 38965002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014744`
GeneID	`131014744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014744`
原始查询	`LOC131014744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840544]; symbol=AT1G36380; hit=AT1G36380; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840544]; symbol=AT1G36380; hit=AT1G36380; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G36380` (AT1G36380) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840544] identity=63.1; qcov=0.556; evalue=9.21e-24; confidence=medium
Rice	`Os02g0552400` - identity=46.6; qcov=0.624; evalue=3.61e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15938 (DUF4750)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057798813.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057798829.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057798829.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798813.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798813.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38961642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A24,B33,B69,C19
`Chr1:38961660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B77,C25,C34,D8
`Chr1:38961673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:38961685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:38961693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:38961715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C19
`Chr1:38961723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:38963481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:38963515`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr1:38963515`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr1:38964125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,B76
`Chr1:38964799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798813.1

162 aa

162

DUF4750

PF15938 DUF4750 39-91 aa

XP_057798821.1

141 aa

141

DUF4750

PF15938 DUF4750 39-91 aa

XP_057798829.1

117 aa

117

DUF4750

PF15938 DUF4750 39-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798813.1`	Pfam	`PF15938`	DUF4750	Family	39	91	1.9e-22	79.4	Domain of unknown function (DUF4750)
`XP_057798821.1`	Pfam	`PF15938`	DUF4750	Family	39	91	1.4e-22	79.9	Domain of unknown function (DUF4750)
`XP_057798829.1`	Pfam	`PF15938`	DUF4750	Family	39	91	9.8e-23	80.4	Domain of unknown function (DUF4750)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942830.1
TCGCTATATGTATATAAACACGATAGGTCAATGTCGTCAACCTGGAGCTGGAAACCTTCAAATTCAATTCAACCTCCCAAAAATGGAGTCTTTCTCCGATGAATCGCTCTTTCTCTCCTACTCGGATTACTTCAATTTTCTTCTCCTTCGCCCCCTTGCTGCTATTCTCTTCACCGTCTCCTTACTCTTCTTTGGGTGGTTCTTGGCATGGAAGCTGGTGCTGGTTCATGTACCTCTAGTGCAGGAGATTTTTGGTCTGA...

XM_057942846.1
TCTTTATGTATATATACAAAAAAACAAAACGTTGATTATAAATCGCTATATGTATATAAACACGATAGGTCAATGTCGTCAACCTGGAGCTGGAAACCTTCAAATTCAATTCAACCTCCCAAAAATGGAGTCTTTCTCCGATGAATCGCTCTTTCTCTCCTACTCGGATTACTTCAATTTTCTTCTCCTTCGCCCCCTTGCTGCTATTCTCTTCACCGTCTCCTTACTCTTCTTTGGGTGGTTCTTGGCATGGAAGCTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131014744
ATGTATATAAACACGATAGGTCAATGTCGTCAACCTGGAGCTGGAAACCTTCAAATTCAATTCAACCTCCCAAAAATGGAGTCTTTCTCCGATGAATCGCTCTTTCTCTCCTACTCGGATTACTTCAATTTTCTTCTCCTTCGCCCCCTTGCTGCTATTCTCTTCACCGTCTCCTTACTCTTCTTTGGGTGGTTCTTGGCATGGAAGCTGGTGCTGGTTCATGTACCTCTAGTGCAGGAGATTTTTGGTCTGAGGAAAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057798813.1
MYINTIGQCRQPGAGNLQIQFNLPKMESFSDESLFLSYSDYFNFLLLRPLAAILFTVSLLFFGWFLAWKLVLVHVPLVQEIFGLRKKTIKPKPPGRRRLTQFYNRINAQNPSSEALPLRNREIKSIKDVKGRPCDKADGNATGPILQRHERSAENREGLNST

XP_057798821.1
MYINTIGQCRQPGAGNLQIQFNLPKMESFSDESLFLSYSDYFNFLLLRPLAAILFTVSLLFFGWFLAWKLVLVHVPLVQEIFGLRKKTIKPKPPGRRRLTQFYNRINAQNPSSEDAYAHKEILFSSMHLVIKRARVNQWLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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