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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003905`

染色体: Chr03 坐标: 58145450-58146384 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003905`
名称	SmilChr03G003905
描述	probable thionin-2.4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58145450 - 58146384 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014761`
GeneID	`131014761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014761`
原始查询	`LOC131014761`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thionin-2.4
产物	probable thionin-2.4
Arabidopsis	`AT1G66100` (AT1G66100) Plant thionin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842924] identity=51.9; qcov=0.992; evalue=9.62e-37; confidence=medium
Rice	`Os06g0514100` (Osthi7) - identity=50; qcov=1.01; evalue=5.5e-32; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00321 (Thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057798830.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057798830.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798830.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798830.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58145710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:58145760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:58145799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:58146154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798830.1

136 aa

136

Thionin

PF00321 Thionin 29-73 aa

XP_057798831.1

132 aa

132

Thionin

PF00321 Thionin 29-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798830.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	29	73	1.3e-13	51.9	Plant thionin
`XP_057798831.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	29	73	1.3e-13	51.9	Plant thionin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942847.1
TGTTGGGTTTAGATAAGGTGGTAGGTGAAGCTTATTAAGATATGACAAATGAAGTATGTGGTGAGGGTATGCACAACACCAAGTATTTAAGTTGCTAGTTTGATCAGCATTTTATCAATAAAAGTTGTGTATATTTTGTAATCAAGAGAAGATGATATCGATGGAAGGTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTAGTGAGCCTTGTTTTGGGACAATTTGAAGTTGGGGCGGCAAAGAGTTGTTGCCCAAACCCCAAAG...

XM_057942848.1
TGTTGGGTTTAGATAAGGTGGTAGGTGAAGCTTATTAAGATATGACAAATGAAGTATGTGGTGAGGGTATGCACAACACCAAGTATTTAAGTTGCTAGTTTGATCAGCATTTTATCAATAAAAGTTGTGTATATTTTGTAATCAAGAGAAGATGATATCGATGGAAGGTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTAGTGAGCCTTGTTTTGGGACAATTTGAAGTTGGGGCGGCAAAGAGTTGTTGCCCAAACCCCAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014761
ATGATATCGATGGAAGGTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTAGTGAGCCTTGTTTTGGGACAATTTGAAGTTGGGGCGGCAAAGAGTTGTTGCCCAAACCCCAAAGCCAGAAATGTCTTTAATCTCTGTAGCTTTACGCCGGGAGGCAGCGATTCAGTCTGTGCATCACTCAGTGGATGCAAAATCGTTAATGGGGAATGTCCCAATGGTTGGAATTATAGTTTTCTCGAAAACACTGGTGGTAATGCAGTCCATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798830.1
MISMEGKSLIMSALLVSLVLGQFEVGAAKSCCPNPKARNVFNLCSFTPGGSDSVCASLSGCKIVNGECPNGWNYSFLENTGGNAVHEYCKLGCASSVCAAITTLQNSDASEVVNEAVEKCSQACSALCTKASITAA

XP_057798831.1
MISMEGKSLIMSALLVSLVLGQFEVGAAKSCCPNPKARNVFNLCSFTPGGSDSVCASLSGCKIVNGECPNGWNYSFLENTVHEYCKLGCASSVCAAITTLQNSDASEVVNEAVEKCSQACSALCTKASITAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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