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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003912`

染色体: Chr03 坐标: 58202966-58208235 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003912`
名称	SmilChr03G003912
描述	glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58202966 - 58208235 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014770`
GeneID	`131014770`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014770`
原始查询	`LOC131014770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1
产物	glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1
Arabidopsis	`AT5G04500` (AT5G04500) glycosyltransferase family protein 47 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830329] identity=62.1; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0540000` (GINT1) - identity=59.6; qcov=0.911; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF09258 (Glyco_transf_64); PF24793 (GINT1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014770

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798842.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798842.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798842.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798842.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58203115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C49
`Chr3:58203295`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr3:58203295`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr3:58203301`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C22
`Chr3:58203301`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C22
`Chr3:58203308`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr3:58203308`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr3:58203337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58203439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:58203473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B56,B6,B96,C67
`Chr3:58203514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:58203829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798842.1

756 aa

378

756

GINT1_N

Glyco_transf_64

PF24793 GINT1_N 71-374 aa PF09258 Glyco_transf_64 509-747 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798842.1`	Pfam	`PF24793`	GINT1_N	Repeat	71	374	4.1e-172	571.9	Glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1, N-terminal
`XP_057798842.1`	Pfam	`PF09258`	Glyco_transf_64	Domain	509	747	3e-61	207.5	Glycosyl transferase family 64 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942859.1
AAAACTGTCCGTAAATTCCATCACCTTTTCCAGTTTGTGTGTGTGACATTACATTCAAGAACCCAAAAATCTTTCTAGATTCAAATCACAATAATACGAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGGAAAGGCGAAATTTTCAGAATTCGAAAGGTTTCCTTTACGGCGGACGAAAATTAATGCAGGAAATTATAGTTTATCCGTCGCATGCAGAGCCGGGGCTCCGACGGTGAGACTTCTCCGGCGGCTGCGGCGTCGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014770
ATGGGTTCGAGCCCGACCCCGAGCACCGGCGGCGGAGGGTGGCGGTGGCACGGAGGCGGGAAAAATAGCAACGGGAATAACGAAGCGTGTGTGTTATCGTCAACTTTTGCGTATTTCTTGTCGTCGTTTGTGGTATTGGGCGTGATTGGGAGTTTGTATGGGAGGTACATGGTCACGCCTAACGTGCGCCGGGGGATCGCGGCGCTTGGTTGTTTAGACGACAGTGAGGGCTCGTGGGCCCTCGGCGTTTTCTATGGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798842.1
MGSSPTPSTGGGGWRWHGGGKNSNGNNEACVLSSTFAYFLSSFVVLGVIGSLYGRYMVTPNVRRGIAALGCLDDSEGSWALGVFYGDSPFSLRPIEAMNVWKDKSAAWPVANPVMTCASLSDAGFPSNFVADPFLYIQGDVLYLFYETKNSVTWHGDIGVAQSVDKGVTWKQLGIALDEEWHLSYPYVFDYNGNIYMVPEGSLNGDIRLYRATNFPLEWTLEKIILKRPLIDSSIVAHEGKLWLFGSDNSWIGTEQNGQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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