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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003914`

染色体: Chr03 坐标: 58229953-58232344 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003914`
名称	SmilChr03G003914
描述	phytol kinase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58229953 - 58232344 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014771`
GeneID	`131014771`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014771`
原始查询	`LOC131014771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytol kinase 1, chloroplastic
产物	phytol kinase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G04490` (VTE5) phytol kinase 1 VTE5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830328] identity=65.2; qcov=0.832; evalue=2.28e-121; confidence=high
Rice	`Os01g0832000` (CDS5) - identity=44.4; qcov=0.859; evalue=8.68e-75; confidence=medium
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0010189 (vitamin E biosynthetic process); GO:0010276 (phytol kinase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014771

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798843.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057798843.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798843.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798843.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798843.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58230184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:58230219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B70,C28
`Chr3:58232014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B53,C11,C39,C69
`Chr3:58232078`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr3:58232078`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr3:58232139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C11,C39,C69

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942860.1
AAAGTATGTACTCGCCTCAATAAACGTTCAATTGACATCAATTAGTGCGGCAAATAAAATCAAAATTGGGTCGAAAAGGAGAGAACCGTACGGACCCTACCGCACTGCGTGAGTGACCTTAATATTTTAGTTACTGATGGGCTACGGTGCTATCGTGAGCCGAGGTGCTGCAACCACAGCCGCCACCTTATCCTCCGCACACTATCTCTGCCGCGGCGTGACAACTCCATCCTCCACTCCCCCGCTCCTTCCCGCCGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014771
ATGGGCTACGGTGCTATCGTGAGCCGAGGTGCTGCAACCACAGCCGCCACCTTATCCTCCGCACACTATCTCTGCCGCGGCGTGACAACTCCATCCTCCACTCCCCCGCTCCTTCCCGCCGCCCTCTCCGCACGCATTCTGATCCAGCATGGTAAGCTCCGCCGCCCGGGAACCGCCGCCGCCGGAGTTTCCGGCGAACTGCTTCAGGACGCCGGCGCCACCGCGCTGGTTTTCGGCGGTGCTTATGGTCTAGTCTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798843.1
MGYGAIVSRGAATTAATLSSAHYLCRGVTTPSSTPPLLPAALSARILIQHGKLRRPGTAAAGVSGELLQDAGATALVFGGAYGLVSTFDNLTRRNIIEQKLSRKLVHIFSGLLFLASWPIFSISTGARYFASLVPCVNCLRLVINGLSLSTDEGLIKSVSREGKPEELLRGPLYYVLVLILCAIVFWRDSPVGMISLSMMCGGDGIADIMGRRFGSTKIPYNPLKSWAGSISMFLFGFLVSISVLYYFSALGYVELDWMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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