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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003923`

染色体: Chr03 坐标: 58313188-58319474 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003923`
名称	SmilChr03G003923
描述	protein BTR1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58313188 - 58319474 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014781`
GeneID	`131014781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014781`
原始查询	`LOC131014781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BTR1-like
产物	protein BTR1-like
Arabidopsis	`AT5G04430` (BTR1L) binding to TOMV RNA 1L (long form) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830322] identity=62.3; qcov=0.975; evalue=1.03e-140; confidence=high
Rice	`Os02g0822300` - identity=57.2; qcov=1.01; evalue=2.92e-123; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798852.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798852.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057798852.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057798852.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58314539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:58314804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:58316300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58316376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:58316444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:58318774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798852.1

320 aa

160

320

KH_1

PF00013 KH_1 40-105 aa PF00013 KH_1 126-191 aa PF00013 KH_1 246-311 aa

XP_057798853.1

318 aa

159

318

KH_1

PF00013 KH_1 40-105 aa PF00013 KH_1 126-191 aa PF00013 KH_1 244-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798852.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	40	105	9.5e-47	157.3	KH domain
`XP_057798852.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	126	191	9.5e-47	157.3	KH domain
`XP_057798852.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	246	311	9.5e-47	157.3	KH domain
`XP_057798853.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	40	105	9.3e-47	157.4	KH domain
`XP_057798853.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	126	191	9.3e-47	157.4	KH domain
`XP_057798853.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	244	309	9.3e-47	157.4	KH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942869.1
AGTAAAAAAACGGCCCAAATGTAAATCTAAATTTATGAAGCCCAGTAGCAATAAAAAAATCACATCACGTTTTTTCAACTCTCGCTTCTCTCTCCAGATTTCGATAGCTCTGACCATATACTCTGTATTCTCTCTCTACATATACATAACTATACTCGTTTACATCCTGTTGTACAGGAATTCATGGCAATGGAAGGTGATAAAGCTGCATACGCTGAGGTATCACCCGAGGTTCAGCAGAATCAATCGTCGCCGCGCAA...

XM_057942870.1
AAAAAACGGCCCAAATGTAAATCTAAATTTATGAAGCCCAGTAGCAATAAAAAAATCACATCACGTTTTTTCAACTCTCGCTTCTCTCTCCAGATTTCGATAGCTCTGACCATATACTCTGTATTCTCTCTCTACATATACATAACTATACTCGTTTACATCCTGTTGTACAGGAATTCATGGCAATGGAAGGTGATAAAGCTGCATACGCTGAGGTATCACCCGAGGTTCAGCAGAATCAATCGTCGCCGCGCAAATCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014781
ATGGCAATGGAAGGTGATAAAGCTGCATACGCTGAGGTATCACCCGAGGTTCAGCAGAATCAATCGTCGCCGCGCAAATCACCGCCTCCGCCAGACAGCGAAGAGAAGACCACTCATATTAGGTTCCTCTTATCCAATGCTGAAGCTGGTTCTGTTATCGGAAAAGGCGGTTCAACAATCAACGATATTCAGTCACAATCTGGAGCACGCATCCAGTTGTCGCGCAATTATGAGTACTTTCCTGGCACATCTGATAGGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798852.1
MAMEGDKAAYAEVSPEVQQNQSSPRKSPPPPDSEEKTTHIRFLLSNAEAGSVIGKGGSTINDIQSQSGARIQLSRNYEYFPGTSDRVVMVSGRVDDILKAVDLIMSKLMDEFYVEDGGQVDPESKIRLVVPNSSCGGIIGKGGAIIRSLIEDSRATIKISPQDNFYPGLHDRLVTVGGALDEQMRAIDLIIQKLVEDQHYLQSANAPFPYAAVAYNGMNYGPNGAGGKYQNNRFPNKPQEDRSSSVTIGIPDEHIGIVVG...

XP_057798853.1
MAMEGDKAAYAEVSPEVQQNQSSPRKSPPPPDSEEKTTHIRFLLSNAEAGSVIGKGGSTINDIQSQSGARIQLSRNYEYFPGTSDRVVMVSGRVDDILKAVDLIMSKLMDEFYVEDGGQVDPESKIRLVVPNSSCGGIIGKGGAIIRSLIEDSRATIKISPQDNFYPGLHDRLVTVGGALDEQMRAIDLIIQKLVEDQHYLQSANAPFPYAAVAYNGMNYGPNGAGGKYQNNRFPNKEDRSSSVTIGIPDEHIGIVVGRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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