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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003931`

染色体: Chr03 坐标: 58377911-58378764 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003931`
名称	SmilChr03G003931
描述	zinc finger protein ZAT5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58377911 - 58378764 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014787`
GeneID	`131014787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014787`
原始查询	`LOC131014787`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT5-like
产物	zinc finger protein ZAT5-like
Arabidopsis	`AT5G04390` (AT5G04390) C2H2-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830318] identity=34.2; qcov=1.35; evalue=1.47e-40; confidence=low
Rice	`Os04g0162500` - identity=35.2; qcov=0.95; evalue=3.16e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13894 (zf-C2H2_4); PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798857.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798857.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798857.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798857.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58378064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B26
`Chr3:58378117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B99,C20
`Chr3:58378123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D1
`Chr3:58378135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:58378159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:58378162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:58378174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B136,B24,B26,B48
`Chr3:58378261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:58378324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr3:58378327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B37,B54,B86
`Chr3:58378338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C44
`Chr3:58378392`	`CGG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B132,B37,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798857.1

239 aa

120

239

zf-C2H2_6

zf-C2H2_4

PF13912 zf-C2H2_6 92-117 aa PF13912 zf-C2H2_6 168-193 aa PF13894 zf-C2H2_4 169-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798857.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	92	117	1.1e-24	86.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057798857.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	168	193	1.1e-24	86.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057798857.1`	Pfam	`PF13894`	zf-C2H2_4	Domain	169	191	1.2e-09	38.8	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942874.1
TCTCTCTCTCCCCCCCTAGAATGTGAGAGAAAAGAAATCAACAAACGCGAAAACAGCATCCAACATACATAGTCTCTACACGGCGGTGGTGGGCCGGGATATATATATATGGAGACCGCGACGGAAGAGGCGGCGGCGACGCCGTGTTTGAATACGGACCTCATTACGAAAGGCAAACGAACCAAGAGAGAAAGACCTAATTCCCCGGTTTCCTTCACCATCACACCACCCCCACGCGCCACCGCCTCATCGGAGGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014787
ATGGAGACCGCGACGGAAGAGGCGGCGGCGACGCCGTGTTTGAATACGGACCTCATTACGAAAGGCAAACGAACCAAGAGAGAAAGACCTAATTCCCCGGTTTCCTTCACCATCACACCACCCCCACGCGCCACCGCCTCATCGGAGGAGAGCACCACGACCGAGGAAGCCGACACCGCCAGGTGCCTCATCCTCCTCTCCCGGGGCCACTTCACCAACAACCGCCGCAGCGACGCCGCGACCACCTCCTACGGCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798857.1
METATEEAAATPCLNTDLITKGKRTKRERPNSPVSFTITPPPRATASSEESTTTEEADTARCLILLSRGHFTNNRRSDAATTSYGGGAACMYTCKTCNRSFSSFQALGGHRASHKKPRNEKRYAIFSDDEDLTSPSSSSRNKFSPTSLSLQLSSVSTTTTTAVKSPRVHECSYCGAEFASGQALGGHMRKHRGAAAPSPRGVDEVEAGKWLSLDLNLPVPEDERERSPNRIPPPLLLHP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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