当前解析结果
SmilChr03G003937| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003937 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003937 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003937 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 58433387 - 58434963 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014791 |
|---|---|
| GeneID | 131014791 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014791 |
| 原始查询 | LOC131014791 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | enabled-like protein (DUF1635) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832357]; symbol=AT5G22930; hit=AT5G22930; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | enabled-like protein (DUF1635) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832357]; symbol=AT5G22930; hit=AT5G22930; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G22930 (AT5G22930)enabled-like protein (DUF1635) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832357] identity=39.1; qcov=0.948; evalue=4.64e-47; confidence=medium |
| Rice | Os05g0115100 (OJ1654_B10.11-2)- identity=32.5; qcov=0.889; evalue=1.51e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07795 (DUF1635) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014791 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798863.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057798863.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798863.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798863.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798863.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:58433858 |
A |
AAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B104,B99,C54,C81 |
Chr3:58433858 |
A |
AAG |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | B104,B99,C54,C81 |
Chr3:58434082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr3:58434124 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:58434133 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr3:58434394 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B120,C7 |
Chr3:58434542 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr3:58434569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798863.1PF07795
DUF1635 18-254 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798863.1 |
Pfam | PF07795 |
DUF1635 | Family | 18 | 254 | 1.8e-63 | 215.1 | Protein of unknown function (DUF1635) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。