当前解析结果
SmilChr03G003938| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003938 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003938 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003938 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 58464969 - 58467897 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014793 |
|---|---|
| GeneID | 131014793 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014793 |
| 原始查询 | LOC131014793 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014793 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798865.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057798865.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057798865.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798865.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798865.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:58465155 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,C6,D6 |
Chr3:58465168 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A15,B12,B122,B21,B24,B26,B30,B68,B78,B85,C28,C58,C77,D11 |
Chr3:58465170 |
AGG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 53 | A11,A15,A5,A9,B102,B113,B115,B119,B12,B122,B132,B136,B140,B21,B24,B26,B3,B30,B38,B39,B47,B53,B63,B64,B68,B7,B78,B85,B87,B96,B98,C1,C11,C14,C19,C24,C28,C30,C32,C33,C41,C42,C47,C49,C5,C55,C56,C58,C63,C68,C77,D11,D8 |
Chr3:58465199 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B64,C24,C64,C9 |
Chr3:58465205 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B58 |
Chr3:58465216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:58465224 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 13 | B12,B122,B21,B24,B26,B30,B68,B78,B85,C28,C58,C77,D11 |
Chr3:58465227 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,C25,C5 |
Chr3:58465257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C11,C69,C74 |
Chr3:58465259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B63,B83,C32 |
Chr3:58465276 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B32,C25,C5 |
Chr3:58465277 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C24,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。