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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003948`

染色体: Chr03 坐标: 58531954-58534112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003948`
名称	SmilChr03G003948
描述	uncharacterized SmilChr03G003948
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58531954 - 58534112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014800`
GeneID	`131014800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014800`
原始查询	`LOC131014800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818506]; symbol=AT2G39210; hit=AT2G39210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818506]; symbol=AT2G39210; hit=AT2G39210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39210` (AT2G39210) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818506] identity=67.1; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0800000` (OSJNBa0052F07.13) - identity=58.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798871.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057798871.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798871.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798871.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58532391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:58532461`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C73
`Chr3:58532461`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C73
`Chr3:58532577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:58532605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:58532982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:58532986`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr3:58532986`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58533250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:58533415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B123,B88,C86
`Chr3:58533562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:58533600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798871.1

593 aa

296

593

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 21-266 aa PF23262 NFD4_C 343-551 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798871.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	21	266	3.6e-88	296.0	Nodulin-like
`XP_057798871.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	343	551	6.8e-14	52.9	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942888.1
TTGCCCGGGTATACACATTATAAATGACCCCACTTGCTTCACACATAAATACGAACGAGACATGCAAATTTACAAACATAGTCTTTCTCTAAATTAAATGTTGTTTGTCTCCTAGTTAGCGGCGATGCTCAAATAGCTAGGGATATCTTCATCACTCATAAATTAAACCAATTACAACTACATTTCTCCCACCCTATTGTATATTAATCTAACTAACCATGGTGGCCGCAACCAACGAGTCGGGCACCGGCTCCTTCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014800
ATGGTGGCCGCAACCAACGAGTCGGGCACCGGCTCCTTCGCGGCCCAAGTGATCACGGGGCGATGGTTCATGGTATTCGCCACCACCCTGATCATGGCCGCGGCCGGGGCCACCTACATGTTCGGTCTGTATTCTCCAGAGATCAAAAAATCTCTGGGGTACGACCAGACCACCCTCAACCTCCTCTCCTTCTTCAAGGACTTCGGCTCCAATGTCGGGGTCCTGGCGGGGCTCATCAACGAGGTGACCCCGCCGTGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798871.1
MVAATNESGTGSFAAQVITGRWFMVFATTLIMAAAGATYMFGLYSPEIKKSLGYDQTTLNLLSFFKDFGSNVGVLAGLINEVTPPWVVLSIGSVLNLFGYVMIWLAVTRRIARPQVWHMCLYICIGANSQSFANTGALVTAVKNFPESRGAVLGLLKGFVGLSGAIITQIYNAVYHNDPRALILLIGWLPAAISFVFLRTIRIIKIVRIPHELKVFYKFLYVSLGLAGFLMILIILQKQLNFTRTEFIIGAATVICLIFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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