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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003949`

染色体: Chr03 坐标: 58552442-58553992 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003949`
名称	SmilChr03G003949
描述	probable cysteine protease RD19D
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58552442 - 58553992 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014804`
GeneID	`131014804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014804`
原始查询	`LOC131014804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cysteine protease RD19D
产物	probable cysteine protease RD19D
Arabidopsis	`AT3G54940` (AT3G54940) Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824659] identity=67.8; qcov=0.97; evalue=1.03e-180; confidence=high
Rice	`Os07g0480900` (OsEnS-106) - identity=63; qcov=0.903; evalue=5.66e-152; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057798876.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.60000	`XP_057798876.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057798876.1`
4	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057798876.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58552493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C72
`Chr3:58552588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C52,C72
`Chr3:58552635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58552797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:58552809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr3:58553556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:58553687`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C45
`Chr3:58553687`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C45
`Chr3:58553835`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	170	A10,A11,A13,A14,A18,A19,A20,A22,A23,A24,A25,A4,A6,A7,A9,B1,B100,B103,B104,B105,B107,B109,B11,B110,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B122,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B138,B139,B16,B18,B19,B2,B21,B23,B24,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B61,B62,B64,B67,B68,B69,B7,B75,B77,B78,B79,B80,B82,B83,B84,B87,B88,B90,B92,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C2,C20,C21,C22,C25,C26,C28,C29,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C60,C63,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C81,C84,C86,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D8
`Chr3:58553842`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	53	A23,A24,A3,A5,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B110,B111,B113,B128,B133,B135,B137,B140,B15,B20,B24,B26,B31,B34,B52,B53,B59,B71,B78,B8,B86,B89,B94,B95,B97,C18,C23,C31,C35,C47,C52,C55,C6,C61,C62,C77,C82,C83,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798876.1

371 aa

186

371

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 55-111 aa PF00112 Peptidase_C1 140-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798876.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	55	111	1.3e-14	55.0	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057798876.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	140	364	2.3e-73	247.7	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942893.1
AGTAAAACCAAGAATCCAAACACACATAAAAAATGAAAGGAGGAGGTCTAACGTACGCAGCAGCGTGTCTCGCAGCCGCACTGTTAACCTGCGCCGTCAGCCTCCGCGCCGACCCCGAGCTCGATCCGAAGATCCTCCAGGTGACCGGTAACCGCCGCAACCACCAGCTCCTCGGCACGGCGGCGGAGGTCCAGTTCAAGAGCTTCGTCCAGGAGTTCGGGAAGGAGTACTCCACTCGCGCGGAGTACCTGCACCGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014804
ATGAAAGGAGGAGGTCTAACGTACGCAGCAGCGTGTCTCGCAGCCGCACTGTTAACCTGCGCCGTCAGCCTCCGCGCCGACCCCGAGCTCGATCCGAAGATCCTCCAGGTGACCGGTAACCGCCGCAACCACCAGCTCCTCGGCACGGCGGCGGAGGTCCAGTTCAAGAGCTTCGTCCAGGAGTTCGGGAAGGAGTACTCCACTCGCGCGGAGTACCTGCACCGCCTCGGCGTCTTCGCCGAGAACTTGATCAGGGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798876.1
MKGGGLTYAAACLAAALLTCAVSLRADPELDPKILQVTGNRRNHQLLGTAAEVQFKSFVQEFGKEYSTRAEYLHRLGVFAENLIRAAEHQVLDPTAKHGVTQFSDLSPEEFEGMYMGVRGASPEPSENGVAAAEIDAEDLPESFDWRERGAVTDVKMQGSCGSCWAFSTTGAIEGANFIASGKLLNLSEQQLVDCDHACDAKEKSACDNGCSGGLMTNAYKYLMAAGGIEEESSYPYTAKRGECKFRPNNVAVKVANFST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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