当前解析结果
SmilChr03G003946| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003946 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003946 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003946 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 58518743 - 58521751 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014809 |
|---|---|
| GeneID | 131014809 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014809 |
| 原始查询 | LOC131014809 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014809 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057798888.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057798888.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057798887.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057798887.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057798887.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:58520126 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr3:58520135 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A1,A25,A5,B10,B136,B22,B32,B46,B60,B74,B76,B87,C20,C21,C23,C38,C42,C6,C70,C73,D4 |
Chr3:58520186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,C72 |
Chr3:58520195 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C1,C17 |
Chr3:58520223 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B106,B31,B86,C35 |
Chr3:58520225 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:58520246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A20,B19,B2,B56,B6,B66,B9,B96,C1,C17,C27,C30,C67,C75,D1 |
Chr3:58520633 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C1,C17 |
Chr3:58520648 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 39 | A15,A16,A4,B111,B115,B12,B123,B129,B14,B15,B30,B35,B36,B42,B43,B5,B55,B63,B66,B78,B83,B85,B88,B93,B95,B98,C13,C20,C29,C3,C39,C52,C64,C66,C79,C86,C87,C9,D1 |
Chr3:58520885 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B106,B31,B86,C35 |
Chr3:58521433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:58521450 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。