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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003966`

染色体: Chr03 坐标: 58714447-58715616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003966`
名称	SmilChr03G003966
描述	UPS-like protein C36.10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58714447 - 58715616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014822`
GeneID	`131014822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014822`
原始查询	`LOC131014822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPS-like protein C36.10
产物	UPS-like protein C36.10
Arabidopsis	`AT5G13070` (AT5G13070) MSF1-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831146] identity=77; qcov=0.984; evalue=2.11e-110; confidence=high
Rice	`Os02g0717900` - identity=51.4; qcov=0.973; evalue=1.04e-65; confidence=high
GO	GO:0005758 (mitochondrial intermembrane space); GO:0015914 (phospholipid transport); GO:1990050 (phosphatidic acid transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF04707 (PRELI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798903.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057798904.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798901.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798901.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057798901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58714747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:58714768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58714774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C66
`Chr3:58714818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C15
`Chr3:58714818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:58714920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr3:58714963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B17,B38
`Chr3:58714984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B17,B38
`Chr3:58715111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:58715160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C27
`Chr3:58715160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798901.1

250 aa

125

250

PRELI

PF04707 PRELI 81-243 aa

XP_057798902.1

245 aa

122

245

PRELI

PF04707 PRELI 76-238 aa

XP_057798903.1

225 aa

112

225

PRELI

PF04707 PRELI 56-218 aa

XP_057798904.1

186 aa

186

PRELI

PF04707 PRELI 17-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798901.1`	Pfam	`PF04707`	PRELI	Family	81	243	3.6e-48	164.1	PRELI-like family
`XP_057798902.1`	Pfam	`PF04707`	PRELI	Family	76	238	3.4e-48	164.1	PRELI-like family
`XP_057798903.1`	Pfam	`PF04707`	PRELI	Family	56	218	2.7e-48	164.5	PRELI-like family
`XP_057798904.1`	Pfam	`PF04707`	PRELI	Family	17	179	1.5e-48	165.3	PRELI-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942920.1
GCCCTATTGCTTTTGTCTTGATTCATGAACAATTAATCAGTTTTGGCAATCTTTTTTAGATTTATAATTAATCTTTGCATAAATATGATTTGAAATTTGTCTCTGCTGTGTTTGAATGTTATACAATGCTTGCAAATGCAACTTGTTGCTTTTGCTTCAACTTCAGATTGCCTCAATTTATTCCTAGCTGCAGCCTATATTCTTCTTTGTCCAAGGACGTATTGTGAACATGACGATACAAGAATTTGTCTGGAGATGGT...

XM_057942919.1
GCCCTATTGCTTTTGTCTTGATTCATGAACAATTAATCAGTTTTGGCAATCTTTTTTAGATTTATAATTAATCTTTGCATAAATATGATTTGAAATTTGTCTCTGCTGTGTTTGAATGTTATACAATGCTTGCAAATGCAACTTGTTGCTTTTGCTTCAACTTCAGATTGCCTCAATTTATTCCTAGCTGCAGCCTATATTCTTCTTTGTCCAAGGACGTATTGTGAACATGACGATACAAGAATTTGTCTGGAGGTTGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131014822
ATGCAACTTGTTGCTTTTGCTTCAACTTCAGATTGCCTCAATTTATTCCTAGCTGCAGCCTATATTCTTCTTTGTCCAAGGACGTATTGTGAACATGACGATACAAGAATTTGTCTGGAGATGGTTAGAGCATATTCTCAAGAACACACATACAAGCATCCATGGGAACGAGTAACAGCTGCGTCGTGGCGCAAATTTGCTGACCCTGAGAACAAACGCACGCTGTCTCACATTGTCGAGGTTGATACACTGAGCCACAA...

LOC131014822
ATGCAACTTGTTGCTTTTGCTTCAACTTCAGATTGCCTCAATTTATTCCTAGCTGCAGCCTATATTCTTCTTTGTCCAAGGACGTATTGTGAACATGACGATACAAGAATTTGTCTGGAGGTTGATCCATGGTTGTGTTTAGCTTTGTCCAATTACTATTTTGTTAGAATTGCCTTGAGAATGGTTAGAGCATATTCTCAAGAACACACATACAAGCATCCATGGGAACGAGTAACAGCTGCGTCGTGGCGCAAATTTGC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057798901.1
MQLVAFASTSDCLNLFLAAAYILLCPRTYCEHDDTRICLEVDPWLCLALSNYYFVRIALRVCLLKMVRAYSQEHTYKHPWERVTAASWRKFADPENKRTLSHIVEVDTLSHKLERSSGKLYTTRAITVHAPGPWFLRKMIGQDICHCVESTVVDAQARSMQLATRNISLEKFLEVEEKIRYDPHPEDPVGWTICRQETRITIKPLSALATMAEKIEQKCVEKFQHNSAKGREVMERICKYLEAESRGISA

XP_057798902.1
MQLVAFASTSDCLNLFLAAAYILLCPRTYCEHDDTRICLEVDPWLCLALSNYYFVRIALRMVRAYSQEHTYKHPWERVTAASWRKFADPENKRTLSHIVEVDTLSHKLERSSGKLYTTRAITVHAPGPWFLRKMIGQDICHCVESTVVDAQARSMQLATRNISLEKFLEVEEKIRYDPHPEDPVGWTICRQETRITIKPLSALATMAEKIEQKCVEKFQHNSAKGREVMERICKYLEAESRGISA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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