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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003979`

染色体: Chr03 坐标: 58812972-58814596 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003979`
名称	SmilChr03G003979
描述	WUSCHEL-related homeobox 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58812972 - 58814596 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014836`
GeneID	`131014836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014836`
原始查询	`LOC131014836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WUSCHEL-related homeobox 2-like
产物	WUSCHEL-related homeobox 2-like
Arabidopsis	`AT5G59340` (WOX2) WUSCHEL related homeobox 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836053] identity=68.8; qcov=0.821; evalue=1.13e-43; confidence=medium
Rice	`Os01g0840300` (OsWOX2) - identity=85.5; qcov=0.53; evalue=2.58e-35; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0099402 (plant organ development)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798933.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798933.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798933.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798933.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58813761`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A5,B101,B20,B70,B94,B98,C61,C74,D1,D10
`Chr3:58813787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B117,B46
`Chr3:58814141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B85,B94,C14,D7
`Chr3:58814237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C44
`Chr3:58814309`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,A9,B120,B139,B18,B96,C78
`Chr3:58814311`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,A9,B120,B139,B18,B96,C78
`Chr3:58814320`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A11,A9,B120,B139,B18,B26,B96,C66,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798933.1

209 aa

104

209

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 13-72 aa

XP_057798934.1

117 aa

117

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 13-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798933.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	13	72	1.1e-14	54.7	Homeodomain
`XP_057798934.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	13	72	4.3e-15	56.0	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942950.1
ATTAATTAATCACCATCCAGCAGCATAGATTTATTGAAAAAAAAAGAAAAGGAAAGGAAAAAGAGTCGTCTCAATTTCTTACCTCTGAATCAACTCAAACTCTCATCATCCTACCAATCTCTCTCTCTGCCACTCTACTTAGTTATCTGCAATTTCCAAAGCCTAGGCCCTATACTCCTTACTCCTCAATCCCTAATCTGCCCCTACCTCCACCCCTCTTTCATTCCCAATGCTAGGGCCATTTCTGTCATTCCATGCAT...

XM_057942951.1
TTTCCCCAAAAAACACACACACACCCTTACCCTTGTTGATAACAATGGAGGGTGGCGATCAAAATCCTGCAAATGGAGGGTCTCGATGGAACCCAACGAAAGAGCAAATAAACATGCTTGAGAGCTTGTACAGGCAGGGTTTGAGAACTCCAACTGCTGACCAGATTCAGCACATCACTGCAAGGCTCAGAGATTATGGGCACATCGAGGGCAAAAACGTCTTTTACTGGTTCCAGAATCATAAGGCCAGGCAAAGGCAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014836
ATGGAGGGTGGCGATCAAAATCCTGCAAATGGAGGGTCTCGATGGAACCCAACGAAAGAGCAAATAAACATGCTTGAGAGCTTGTACAGGCAGGGTTTGAGAACTCCAACTGCTGACCAGATTCAGCACATCACTGCAAGGCTCAGAGATTATGGGCACATCGAGGGCAAAAACGTCTTTTACTGGTTCCAGAATCATAAGGCCAGGCAAAGGCAGAAGCAGAAACAGGAGACTTTTGCTTTCTACAATCGCTTTCTTCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798933.1
MEGGDQNPANGGSRWNPTKEQINMLESLYRQGLRTPTADQIQHITARLRDYGHIEGKNVFYWFQNHKARQRQKQKQETFAFYNRFLHSPPPLFPPPPPFHNVICSPCYIPPPKKVQLPTALGSVKRCRTIPQSIDSSHLTLTQRYNTTESREHLNSSSHDQETLDLFPIHPTGILQSTSNHDQKNPSFCADKLSTSSDDHPFFDFFRGN

XP_057798934.1
MEGGDQNPANGGSRWNPTKEQINMLESLYRQGLRTPTADQIQHITARLRDYGHIEGKNVFYWFQNHKARQRQKQKQETFAFYNRFLHSPPPLFPPPPPFHNAHATFLHQRRYNSPQH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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