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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003982`

染色体: Chr03 坐标: 58827402-58829961 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003982`
名称	SmilChr03G003982
描述	uncharacterized SmilChr03G003982
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58827402 - 58829961 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014839`
GeneID	`131014839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014839`
原始查询	`LOC131014839`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox071; symbol=OsFbox071; hit=Os02g0199500; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox071; symbol=OsFbox071; hit=Os02g0199500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G43260` (AT2G43260) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818928] identity=22.4; qcov=0.545; evalue=8.65e-06; confidence=weak
Rice	`Os02g0199500` (OsFbox071) - identity=24.5; qcov=0.482; evalue=5.77e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798939.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798939.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798939.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798939.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58827607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:58827611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B122,B48,D6
`Chr3:58827641`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	107	A10,A13,A20,A22,A8,A9,B10,B103,B104,B105,B106,B108,B110,B112,B113,B117,B119,B121,B127,B130,B134,B136,B137,B16,B18,B22,B26,B29,B30,B31,B32,B34,B35,B37,B39,B4,B41,B46,B47,B49,B5,B50,B52,B56,B57,B59,B60,B61,B63,B69,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B8,B82,B84,B86,B88,B9,B93,B94,B98,C1,C13,C14,C15,C18,C19,C22,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C4,C40,C42,C44,C46,C47,C48,C63,C65,C68,C75,C76,C78,C81,C82,C83,C84,C85,C87,D10,D7,D8,D9
`Chr3:58827647`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	107	A10,A13,A20,A22,A8,A9,B10,B103,B104,B105,B106,B108,B110,B112,B113,B117,B119,B121,B127,B130,B134,B136,B137,B16,B18,B22,B26,B29,B30,B31,B32,B34,B35,B37,B39,B4,B41,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B52,B56,B57,B59,B60,B61,B63,B69,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B8,B82,B84,B86,B88,B9,B93,B94,B98,C1,C13,C14,C15,C18,C19,C22,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C4,C40,C44,C46,C47,C48,C63,C65,C68,C75,C76,C78,C81,C82,C83,C84,C85,C87,D10,D7,D8,D9
`Chr3:58827668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B53,B94,C61
`Chr3:58827711`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr3:58827711`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr3:58827735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B53,B78,B94,C61
`Chr3:58827750`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C11,C69,C74
`Chr3:58827750`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr3:58827763`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A5,B32,C73
`Chr3:58827763`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A5,B32,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798939.1

508 aa

254

508

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 32-246 aa PF07734 FBA_1 53-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798939.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	32	246	3.7e-10	40.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057798939.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	53	196	8.7e-16	58.5	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942956.1
ACATGAAATATGATTGCCACCTCCAAACACGAAAGAGAATATATGACGCTTAGGGGTTGATTCCCTTTCTTCCAAATCCATCAATTTTTGATCGACGATGAAGAATTCCGACGAGAAACGCCTTCTTGTGATACGTAACTGTGGAGAGTCGGGTAAGTATCGTTTTACCCCTCTTTCTCCGGGAGATTTATCTGAAATCCATGAAGAAAGTTTCGACCTTCCTTTTCTGCATTCGAAGCCAGAAATTTATTTTAACAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014839
ATGAAGAATTCCGACGAGAAACGCCTTCTTGTGATACGTAACTGTGGAGAGTCGGGTAAGTATCGTTTTACCCCTCTTTCTCCGGGAGATTTATCTGAAATCCATGAAGAAAGTTTCGACCTTCCTTTTCTGCATTCGAAGCCAGAAATTTATTTTAACAGTTGCGGGGGTTTGTTATGTATCTACGAATATGGAGGCCATATTTATGTTTTGAACCCCAAAACCAAACGGTTTCAGTTCTTTCCTACCGAGGAAGTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798939.1
MKNSDEKRLLVIRNCGESGKYRFTPLSPGDLSEIHEESFDLPFLHSKPEIYFNSCGGLLCIYEYGGHIYVLNPKTKRFQFFPTEEVYPFNRTSSTLIGACVCYDSKSDDYKILRVCDDKIRLQTFELYSFEDDSWNQISRVPPFKNIEETRISGFKGTSVRGKCYWFTERGRIVSLDCSEKTLSYIDLPPGCQLCHTHSFRILSELVQFNGGDSLGVVRLGSLQPEPGNYYELWVWGEELKRWDRKFSVSLGGAVGRPPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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